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Book Sections Year : 2022

Calculs d’inférence dans les arbres phylogénétiques

Laurent Guéguen

Abstract

Plusieurs critères permettent d’évaluer la pertinence d’une phylogénie : le nombre minimal d’événements pour la parcimonie, la probabilité des données pour la vraisemblance. Le calcul selon ces critères repose sur des algorithmes de parcours d'arbre similaires et pouvant être décrits de manière très générique. Spécifiquement à chaque critère, il est ensuite possible d’explorer ces parcours pour inférer l’histoire évolutive des données.
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Dates and versions

hal-04059719 , version 1 (07-04-2023)

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Cite

Laurent Guéguen. Calculs d’inférence dans les arbres phylogénétiques. Gilles Didier; Stéphane Guindon. Modèles et méthodes pour l’évolution biologique, ISTE Group, pp.177-202, 2022, 9781789480696. ⟨10.51926/ISTE.9069.ch7⟩. ⟨hal-04059719⟩
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