Evolution and functional relevance of non-coding elements in vertebrate genomes - Archive ouverte HAL
Hdr Année : 2024

Evolution and functional relevance of non-coding elements in vertebrate genomes

Évolution et fonctionnalité des éléments non-codants dans les génomes des vertébrés

Résumé

Rapportrice

Il me semble que l'écriture d'un chapitre de remerciements est toujours difficile. Dans mon cas, cela est dû au grand nombre de personnes que j'aimerais remercier comme il se doit, mais aussi à la peur de ne pas trouver les mots justes pour exprimer toute ma reconnaissance. Tout au long de ma carrière de recherche, j'ai eu la chance d'être entourée par des personnes extraordinaires, qui m'ont fourni d'excellents modèles à suivre et qui m'ont soutenue lors des étapes difficiles. Ici je fais le choix de les présenter dans un ordre chronologique approximatif, sachant que lorsque des ambiguïtés temporelles se sont présentées, toutes les dates pertinentes ont été retenues (oui, une description précise du matériel et méthodes est importante même dans le chapitre de remerciements).

Je remercie donc les enseignant.e.s et les chercheur.e.s qui m'ont fait découvrir la bioinformatique, lors de mes études à l'INSA de Lyon. Parmi les nombreux noms qui me viennent à l'esprit, je dois citer Guillaume Beslon, Hubert Charles, Laurent Duret, Christian Gautier, Carole Knibbe, Jean Lobry et Marie-France Sagot. J'ai découvert la bioinformatique lorsque nous étions jeunes toutes les deux. C'est grâce à ces enseignant.e.s et chercheur.e.s que j'ai acquis une grande affection pour ce domaine de recherche, que je garde encore aujourd'hui.

Je remercie les collègues qui m'ont entourée et encadrée de près ou de loin lors de ma thèse au LBBE. A commencer bien sûr par Jean Lobry, mon directeur de thèse, qui m'a accordé une confiance demesurée et qui m'a soutenue lors de mes nombreux écarts par rapport au chemin établi. Je remercie également Laurent Duret, avec qui j'ai eu la chance de travailler lors de ma dernière année de thèse et pendant un peu de temps après. Depuis ce moment, Laurent n'a cessé de m'impressionner par son immense culture, sa rigueur scientifique, sa brillance et sa modestie, le tout couronné par un don pour les jeux de mots que j'essaye vainement d'imiter (tout comme le reste de ses qualités). C'est également lors de ma thèse que j'ai rencontré Bastien Boussau, qui est rapidement devenu un modèle pour moi, en plus d'un collaborateur et ami, et à qui je dois énormément. Travailler avec Bastien reste toujours très stimulant et je me réjouis de pouvoir le rejoindre dans notre future équipe de recherche.

Je remercie les collègues et collaborateur.rice.s suisses, que j'ai rencontré.e.s lors de mon séjour post-doctoral à Lausanne : Henrik Kaessmann et Denis Duboule, qui m'ont accueillie dans leurs laboratoires respectifs et qui m'on fait découvrir de nouvelles façons de faire de la recherche ; Fabrice Darbellay et Rita Amândio, qui m'ont appris de nouvelles approches pour l'étude des longs ARNs non-codants ; Markus Heim, qui m'a permis de faire de la recherche un peu plus appliquée que d'habitude. Je remercie Magali Soumillon, une super-héroïne qui peut faire à la fois de la bioinformatique de haut niveau, des expériences complexes en biologie moléculaire et du pilotage automobile extrême.

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Dates et versions

tel-04787630 , version 1 (20-11-2024)

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Identifiants

  • HAL Id : tel-04787630 , version 1

Citer

Anamaria Necsulea. Evolution and functional relevance of non-coding elements in vertebrate genomes. Genomics [q-bio.GN]. Université Claude Bernard Lyon I, 2024. ⟨tel-04787630⟩
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