DISSECTION OF THE COORDINATED INTERFERON RESPONSE BY PROMOTER ELEMENTS WITH ENHANCER ACTIVITY
DISSECTION DE LA REPONSE COORDONNEE DE L'INTERFERON PAR DES ELEMENTS PROMOTEURS AVEC UNE ACTIVITE ENHANCER
Résumé
Gene expression is controlled by the involvement of gene-proximal (promoters) and
distal (enhancers) regulatory elements. Previous results have demonstrated that a
subset of gene promoters also termed Epromoters, works as bona fide enhancers and
regulates distal gene expression. We hypothesized that Epromoters might play a key
role in the coordination of rapid gene induction in the stress response, in particular
during inflammation. Using a high-throughput reporter assay we explored the function
of Epromoter in response to type I interferon. We found that STAT1/2 and IRF
transcription factors preferentially bind to IFNa-induced Epromoters and distally
regulate the activation of interferon-response genes. Similar observations were made in
other types of inflammatory response. Our findings suggest that Epromoters might
function as a hub to recruit key TFs required for coordinated regulation of gene clusters
during the inflammatory response, and more generally upon cellular response to intraand extra-cellular signals.
L'expression génique est contrôlée par l'implication des éléments régulateurs du gène
proximal (promoteurs) et distal (enhancer). Des résultats antérieurs ont démontré
qu'un sous-ensemble de promoteurs de gènes, également appelés Epromoteurs,
fonctionne comme des enhancers de bona fide et régule l'expression distale des gènes.
Nous avons émis l'hypothèse que les Epromoteurs pourraient jouer un rôle clé dans la
coordination de l'induction rapide des gènes dans la réponse au stress, en particulier
pendant l'inflammation. En utilisant un test de reporter à haut débit, nous avons exploré
la fonction d'Epromoter en réponse à l'interféron de type I. Nous avons constaté que les
facteurs de transcription STAT1/STAT2 et IRF se lient préférentiellement aux
Epromoteurs induits par l'IFNa et régulent de manière distale l'activation des gènes de
réponse à l'interféron. Des observations similaires ont été faites dans d'autres types de
réponse inflammatoire. Nos résultats suggèrent que les Epromoteurs pourraient
fonctionner comme une plaque tournante pour recruter les TF clés nécessaires à la
régulation coordonnée des grappes de gènes pendant la réponse inflammatoire, et plus
généralement sur la réponse cellulaire aux signaux intra et extracellulaires.
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