Utilisation de la génomique en microbiologie et en écologie microbienne - Archive ouverte HAL Accéder directement au contenu
Hdr Année : 2022

Use of genomics in microbiology and microbial ecology

Utilisation de la génomique en microbiologie et en écologie microbienne

Valerie Barbe

Résumé

Genomics is a modern science that has taken off thanks to the evolution of sequencing and optical mapping technologies. In just a few years, we have gone from studying a gene to studying an entire complex ecosystem. The resulting knowledge is multiple and affects a very wide range of fields of biology: microbiology, health, agronomy, ecology, paleontology, ecotoxicology, etc., ranging from fundamental to applied. The knowledge provided by genomics initially made it possible to better understand the functioning of genomes and now opens up the possibility of studying the existing relationships between organisms in an ecosystem. In this manuscript, I will present various uses of genomics to answer different scientific questions. Comparison of the highlight of structural variants in plants, the study of an anthropogenic ecosystem, the analysis of the main actors that compose it and the search for alternative solutions to conventional plastics which are responsible for emerging pollution, will be discussed.
La génomique est une science moderne qui a eu son essor grâce à l’évolution des technologies de séquençage et de cartographie optique. En seulement quelques années nous sommes passés de l’étude d’un gène à celle de tout un écosystème complexe. Les connaissances qui en découlent sont multiples et touchent un très large éventail des domaines de la biologie : la microbiologie, la santé, l’agronomie, l’écologie, la paléontologie, l’écotoxicologie…., allant du fondamental à l’appliqué. Les connaissances apportées par la génomique a permis dans un premier temps de mieux comprendre le fonctionnement des génomes et ouvre désormais la possibilité d’étudier les relations existantes entre les organismes d’un écosystème. Dans ce mémoire, je vais vous présenter diverses utilisations de la génomique pour répondre à des questions scientifiques différentes. La comparaison de la mise en évidence de variants structuraux chez les plantes, l’étude d’un écosystème anthropique, l’analyse des acteurs principaux qui le composent et la recherche de solutions alternatives aux plastiques conventionnels qui sont responsables d’une pollution émergente, seront abordés.
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Dates et versions

tel-04330922 , version 1 (08-12-2023)

Identifiants

  • HAL Id : tel-04330922 , version 1

Citer

Valerie Barbe. Utilisation de la génomique en microbiologie et en écologie microbienne. Sciences du Vivant [q-bio]. l'Université Paris-Saclay, 2022. ⟨tel-04330922⟩
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