Tara Pacific V9 18S rDNA metabarcoding dataset - Archive ouverte HAL Accéder directement au contenu
Autre Publication Scientifique Année : 2021

Tara Pacific V9 18S rDNA metabarcoding dataset

1 UMR PHIM - Plant Health Institute of Montpellier
2 Cirad-BIOS - Département Systèmes Biologiques
3 TU Kaiserslautern - Technische Universität Kaiserslautern
4 CHU Angers - Centre Hospitalier Universitaire d'Angers
5 CH Laval - Centre Hospitalier de Laval
6 SBR - Station biologique de Roscoff = Roscoff Marine Station
7 ABIMS - ABiMS - Informatique et bioinformatique = Analysis and Bioinformatics for Marine Science
8 FR2424 - Fédération de recherche de Roscoff
9 UMR 8030 - Génomique métabolique
10 LAGE - Laboratoire d'Analyses Génomiques des Eucaryotes
11 ADMM - Adaptation et diversité en milieu marin
12 University of Maine
13 D-BIOL - Department of Biology [ETH Zürich]
14 LBGB - Laboratoire de Bioinformatique pour la Génomique et la Biodiversité
15 GENOSCOPE - Genoscope - Centre national de séquençage [Evry]
16 RSRC - Red Sea Research Centre
17 LabEX CORAIL - Laboratoire d'Excellence CORAIL
18 LECOB - Laboratoire d'Ecogéochimie des environnements benthiques
19 LECOB - Laboratoire d'Ecogéochimie des environnements benthiques
20 LOV - Laboratoire d'océanographie de Villefranche
21 GOSEE - Global Oceans Systems Ecology & Evolution - Tara Oceans
22 CRIOBE - Centre de recherches insulaires et observatoire de l'environnement
23 IRCAN - Institut de Recherche sur le Cancer et le Vieillissement
24 MSI - Maison de la Modélisation, de la Simulation et des Interactions [Sophia-Antipolis]
25 OSU - Oregon State University
26 Tara Expéditions
27 Shimoda Marine Research Center
28 University of Maine - School of Marine Sciences
29 IBENS - Institut de biologie de l'ENS Paris
Guillem Salazar
Benjamin C.C Hume
Emilie Boissin
Stéphane Pesant
Naama Lang Yona
Grace Klinges
  • Fonction : Auteur
Rebecca Vega Thurber
Sylvain Agostini
Bernard Banaigs
Eric Douville
J. Michel Flores
Didier Forcioli
Paola Furla
Eric Gilson
Stéphanie Reynaud
Matthew Sullivan
Olivier Thomas
Romain Troublé
  • Fonction : Auteur
Didier Zoccola
Serge Planes
Denis Allemand
Shinichi Sunagawa
Christian Voolstra
Patrick Wincker
Colomban de Vargas

Résumé

This data is the result of the primary analysis of the V9 18S rDNA metabarcoding sequencing data from the Tara Pacific expedition. The analysis was conducted using cutadapt, vsearch, swarm and lulu. Please refer to the readme file for more details.
Fichier non déposé

Dates et versions

hal-04384095 , version 1 (10-01-2024)

Identifiants

Citer

Frédéric Mahé, Nicolas Henry, Cédric Berney, Julie Poulain, Sarah Romac, et al.. Tara Pacific V9 18S rDNA metabarcoding dataset. 2021, ⟨10.5281/zenodo.5041070⟩. ⟨hal-04384095⟩
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