Imaging and multi-omics datasets converge to define different neural progenitor origins for ATRT-SHH subgroups
María-Jesús Lobón-Iglesias
,
Mamy Andrianteranagna
(1, 2)
,
Zhi-Yan Han
(3, 4)
,
Céline Chauvin
(5)
,
Julien Masliah-Planchon
(6, 7)
,
Valeria Manriquez
(8)
,
Arnault Tauziede-Espariat
(9)
,
Sandrina Turczynski
,
Rachida Bouarich-Bourimi
(6)
,
Magali Frah
(10)
,
Christelle Dufour
(11)
,
Thomas Blauwblomme
(12)
,
Liesbeth Cardoen
(6)
,
Gaelle Pierron
(6)
,
Laetitia Maillot
,
Delphine Guillemot
(6)
,
Stéphanie Reynaud
(13)
,
Christine Bourneix
,
Célio Pouponnot
(14)
,
Didier Surdez
(15, 16)
,
Mylene Bohec
,
Sylvain Baulande
,
Olivier Delattre
,
Eliane Piaggio
,
Olivier Ayrault
,
Joshua Waterfall
,
Nicolas Servant
,
Kevin Beccaria
,
Volodia Dangouloff-Ros
,
Franck Bourdeaut
1
Cancer et génome: Bioinformatique, biostatistiques et épidémiologie d'un système complexe
2 CBIO - Centre de Bioinformatique
3 U830 - Unité de génétique et biologie des cancers
4 PSL - Université Paris Sciences et Lettres
5 UMR_S 845 - Centre de recherche Croissance et signalisation
6 Institut Curie [Paris]
7 Unité de Pharmacogénomique [Institut Curie]
8 U932 - Immunité et cancer
9 GHU Paris Psychiatrie et Neurosciences
10 ICM - Institut du Cerveau = Paris Brain Institute
11 Département de cancérologie de l'enfant et de l'adolescent [Gustave Roussy]
12 Service de neurologie pédiatrique [CHU Necker]
13 LIA ROPSE - Laboratoire International Associé Réponse des Organismes et Populations face au Stress Environnemental - Université Côte d’Azur - Centre Scientifique de Monaco
14 Signalisation, radiobiologie et cancer
15 U830 - Unité de génétique et biologie des cancers
16 UZH - Universität Zürich [Zürich] = University of Zurich
2 CBIO - Centre de Bioinformatique
3 U830 - Unité de génétique et biologie des cancers
4 PSL - Université Paris Sciences et Lettres
5 UMR_S 845 - Centre de recherche Croissance et signalisation
6 Institut Curie [Paris]
7 Unité de Pharmacogénomique [Institut Curie]
8 U932 - Immunité et cancer
9 GHU Paris Psychiatrie et Neurosciences
10 ICM - Institut du Cerveau = Paris Brain Institute
11 Département de cancérologie de l'enfant et de l'adolescent [Gustave Roussy]
12 Service de neurologie pédiatrique [CHU Necker]
13 LIA ROPSE - Laboratoire International Associé Réponse des Organismes et Populations face au Stress Environnemental - Université Côte d’Azur - Centre Scientifique de Monaco
14 Signalisation, radiobiologie et cancer
15 U830 - Unité de génétique et biologie des cancers
16 UZH - Universität Zürich [Zürich] = University of Zurich
María-Jesús Lobón-Iglesias
- Fonction : Auteur
Zhi-Yan Han
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1311723
- ORCID : 0000-0003-2543-1627
Céline Chauvin
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1311724
- ORCID : 0000-0003-4393-1377
Sandrina Turczynski
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1311725
- ORCID : 0000-0001-5475-0227
Christelle Dufour
- Fonction : Auteur
- PersonId : 762019
- ORCID : 0000-0001-5993-8077
Thomas Blauwblomme
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1311726
- ORCID : 0000-0003-4076-9642
Gaelle Pierron
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1196357
- ORCID : 0000-0002-2536-7680
Laetitia Maillot
- Fonction : Auteur
Christine Bourneix
- Fonction : Auteur
Célio Pouponnot
- Fonction : Auteur
- PersonId : 741154
- IdHAL : celio-pouponnot
- ORCID : 0000-0002-9795-0496
- IdRef : 137722761
Didier Surdez
- Fonction : Auteur
- PersonId : 786620
- ORCID : 0000-0002-7118-7859
- IdRef : 238471330
Mylene Bohec
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1195288
- ORCID : 0000-0002-6530-596X
Sylvain Baulande
- Fonction : Auteur
- PersonId : 764519
- ORCID : 0000-0003-3104-1684
- IdRef : 069811245
Olivier Delattre
- Fonction : Auteur
- PersonId : 812657
- ORCID : 0000-0002-8730-2276
- IdRef : 07462766X
Eliane Piaggio
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1173378
- ORCID : 0000-0002-2455-8442
Olivier Ayrault
- Fonction : Auteur
- PersonId : 758713
- ORCID : 0000-0002-7942-6674
- IdRef : 185754961
Joshua Waterfall
- Fonction : Auteur
- PersonId : 797639
- ORCID : 0000-0002-3762-5050
- IdRef : 227577132
Nicolas Servant
- Fonction : Auteur
- PersonId : 918596
- ORCID : 0000-0003-1678-7410
Kevin Beccaria
- Fonction : Auteur
Volodia Dangouloff-Ros
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1311727
- ORCID : 0000-0003-1260-5886
Franck Bourdeaut
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1211310
- ORCID : 0000-0001-9489-6781
Résumé
Abstract Atypical teratoid rhabdoid tumors (ATRT) are divided into MYC, TYR and SHH subgroups, suggesting diverse lineages of origin. Here, we investigate the imaging of human ATRT at diagnosis and the precise anatomic origin of brain tumors in the Rosa26-Cre ERT2 ::Smarcb1 flox/flox model. This cross-species analysis points to an extra-cerebral origin for MYC tumors. Additionally, we clearly distinguish SHH ATRT emerging from the cerebellar anterior lobe (CAL) from those emerging from the basal ganglia (BG) and intra-ventricular (IV) regions. Molecular characteristics point to the midbrain-hindbrain boundary as the origin of CAL SHH ATRT, and to the ganglionic eminence as the origin of BG/IV SHH ATRT. Single-cell RNA sequencing on SHH ATRT supports these hypotheses. Trajectory analyses suggest that SMARCB1 loss induces a de-differentiation process mediated by repressors of the neuronal program such as REST , ID and the NOTCH pathway.