HairSplitter: separating similar strains in metagenome assembly - Archive ouverte HAL Accéder directement au contenu
Poster De Conférence Année : 2023

HairSplitter: separating similar strains in metagenome assembly

Résumé

Similar regions (typically different strains) get collapsed in a single sequence during genome assembly. HairSplitter separates the collapsed regions to obtain the phased, complete assembly, regardless of the number of haplotypes present and their coverage.
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Faure-Roland-Genscale-ISMBECCB2023.pdf (338.2 Ko) Télécharger le fichier
Origine : Fichiers produits par l'(les) auteur(s)

Dates et versions

hal-04272480 , version 1 (06-11-2023)

Licence

Paternité

Identifiants

  • HAL Id : hal-04272480 , version 1

Citer

Roland Faure, Jean-François Flot, Dominique Lavenier. HairSplitter: separating similar strains in metagenome assembly. ISMB/ECCB 2023 - 31st Annual Intelligent Systems For Molecular Biology and the 22nd Annual European Conference on Computational Biology, Jul 2023, Lyon, France. pp.1-1, 2023. ⟨hal-04272480⟩
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