HairSplitter: separating similar strains in metagenome assembly - Archive ouverte HAL
Poster De Conférence Année : 2023

HairSplitter: separating similar strains in metagenome assembly

Résumé

Similar regions (typically different strains) get collapsed in a single sequence during genome assembly. HairSplitter separates the collapsed regions to obtain the phased, complete assembly, regardless of the number of haplotypes present and their coverage.

Domaines

Bio-informatique [q-bio.QM]
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https://hal.science/hal-04272480

Soumis le : lundi 6 novembre 2023-16:46:13

Dernière modification le : jeudi 7 novembre 2024-13:44:03

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Dates et versions

hal-04272480 , version 1 (06-11-2023)

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Paternité

Identifiants

  • HAL Id : hal-04272480 , version 1

Citer

Roland Faure, Jean-François Flot, Dominique Lavenier. HairSplitter: separating similar strains in metagenome assembly. ISMB/ECCB 2023 - 31st Annual Intelligent Systems For Molecular Biology and the 22nd Annual European Conference on Computational Biology, Jul 2023, Lyon, France. pp.1-1, 2023. ⟨hal-04272480⟩

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