A la place des approches qui analysent l'orthographe comme relevant à la fois de la phonographie et de la sémiographie (Jaffré & Pellat 2008), on propose une approche selon laquelle le système orthographique vise moins à représenter les deux faces du signe linguistique, que l'ensemble des niveaux de structuration du langage (Benveniste 1964), depuis le phonème jusqu’au discours, en passant notamment par les composants morphologiques, les mots, et les propositions. Dans cette perspective, la complexité du système orthographique du français doit être rapportée non pas tant au caractère arbitraire d'une norme qu'à un ensemble de particularités morphologiques de la langue française (voir notamment Luzzati2010) d'une part, à une complexité effective tant morphologique que syntaxique des langues naturelles dans leur ensemble d'autre part (voir notamment Fradin 2003, deVogué 2011). On étudiera de ce point de vue deux grandes questions de l'orthographe du français. La première se rapporte à l’orthographe lexicale et concerne les doubles lettres, que l’on présente traditionnellement comme arbitraires (voir cependant Brissaud & Cogis 2011). La seconde se rapporte à l’orthographe grammaticale et concerne l’accord du participe passé, présenté traditionnellement comme étant dépourvu de fondement et imposé sans justification (voir cependant les avancées depuis Wilmet 1999). Sur ces deux points, on soutiendra que les difficultés sont justifiées par le fonctionnement linguistique qu’elles prétendent représenter. On montrera que les doubles lettres trouvent une justification à la fois dans la nature phonologique du contexte et dans la composition morphologique complexe des mots considérés. Et l’on montrera que l'accord du participe reflète ce qui doit être analysé en relation avec le statut syntaxique double des participes concernés. L’orthographe apparaît par conséquent comme le résultat d’un effort pour arriver à représenter une langue dans sa complexité, sans sacrifier en l’occurrence ses dimensions morphologique et syntaxique.