AI-based multi-modal integration of clinical characteristics, lab tests and chest CTs improves COVID-19 outcome prediction of hospitalized patients - Archive ouverte HAL
Rapport (Rapport De Recherche) Année : 2020

AI-based multi-modal integration of clinical characteristics, lab tests and chest CTs improves COVID-19 outcome prediction of hospitalized patients

Emilie Chouzenoux
Paul Herent
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Rémy Dubois
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Nicolas Loiseau
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Paul Trichelair
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Etienne Bendjebbar
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Simon Jegou
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Sagar Verma
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  • IdHAL : versag
Frank Chemouni
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Meriem Sefta
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Paul Jehanno
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Jocelyn Dachary
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Fabien Brulport
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Adrián González
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Olivier Dehaene
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Jean-Baptiste Schiratti
Kathryn Schutte
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Hugues Talbot
Elodie Pronier
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Gilles Wainrib
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Thomas Clozel
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Michael G B Blum
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Résumé

With 15% of severe cases among hospitalized patients​, the SARS-COV-2 pandemic has put tremendous pressure on Intensive Care Units, and made the identification of early predictors of future severity a public health priority. We collected​ ​ clinical and biological data, as well as CT scan images and radiology reports from 1,003 coronavirus-infected patients from two French hospitals. Radiologists' manual CT annotations were also available. We first identified 11 clinical variables and 3 types of radiologist-reported features significantly associated with prognosis. Next, focusing on the CT images, we trained deep learning models to automatically segment the scans and reproduce radiologists' annotations. We also built CT image-based deep learning models that predicted future severity better than models based on the radiologists' scan reports. Finally, we showed that including CT scan features alongside the clinical and biological data yielded more accurate predictions than using clinical and biological data alone. These findings show that CT scans provide insightful early predictors of future severity.
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Dates et versions

hal-02586111 , version 1 (15-05-2020)
hal-02586111 , version 2 (18-05-2020)
hal-02586111 , version 3 (03-07-2020)

Identifiants

  • HAL Id : hal-02586111 , version 2

Citer

Nathalie Lassau, Samy Ammari, Emilie Chouzenoux, Hugo Gortais, Paul Herent, et al.. AI-based multi-modal integration of clinical characteristics, lab tests and chest CTs improves COVID-19 outcome prediction of hospitalized patients. [Research Report] Inria Saclay Ile de France. 2020. ⟨hal-02586111v2⟩
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