Un outil moléculaire basé sur le séquençage haut débit pour caractériser les Fusarium sur céréales
Résumé
Fusarium head blight is a major cereal disease caused by a complex of Fusarium species reducing grain
yield and quality. In addition, some Fusarium species produce mycotoxins, toxic secondary metabolites,
which accumulates in the grains and are a major health and food safety concern due to their toxicity to
humans and animals. A new tool was developed for the assessment of the global Fusarium diversity in
field samples by analysing barcode sequences generated by high throughput sequencing. This approach
may be used to show changes in the composition of the Fusarium complex or detect the emergence of
new Fusarium species.
La fusariose est une maladie des céréales causée par un complexe d’espèces du genre Fusarium. Elle
provoque une baisse du rendement et de la qualité technologique des grains. Certaines espèces de
Fusarium produisent des mycotoxines, métabolites secondaires toxiques, qui s’accumulent dans les
grains et sont transmises le long de la chaîne de transformation agro-alimentaire. Un outil innovant a été
développé permettant de dresser un inventaire exhaustif des espèces de Fusarium présentes dans des
échantillons de céréales par l’analyse de séquences barcodes générées par séquençage haut débit.
Cette approche devra permettre de détecter et gérer plus efficacement les émergences d’espèces de
Fusarium ou toute modification de la diversité du complexe Fusarium.
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