Un outil moléculaire basé sur le séquençage haut débit pour caractériser les Fusarium sur céréales - Archive ouverte HAL Accéder directement au contenu
Article Dans Une Revue Innovations Agronomiques Année : 2017

Un outil moléculaire basé sur le séquençage haut débit pour caractériser les Fusarium sur céréales

Résumé

Fusarium head blight is a major cereal disease caused by a complex of Fusarium species reducing grain yield and quality. In addition, some Fusarium species produce mycotoxins, toxic secondary metabolites, which accumulates in the grains and are a major health and food safety concern due to their toxicity to humans and animals. A new tool was developed for the assessment of the global Fusarium diversity in field samples by analysing barcode sequences generated by high throughput sequencing. This approach may be used to show changes in the composition of the Fusarium complex or detect the emergence of new Fusarium species.
La fusariose est une maladie des céréales causée par un complexe d’espèces du genre Fusarium. Elle provoque une baisse du rendement et de la qualité technologique des grains. Certaines espèces de Fusarium produisent des mycotoxines, métabolites secondaires toxiques, qui s’accumulent dans les grains et sont transmises le long de la chaîne de transformation agro-alimentaire. Un outil innovant a été développé permettant de dresser un inventaire exhaustif des espèces de Fusarium présentes dans des échantillons de céréales par l’analyse de séquences barcodes générées par séquençage haut débit. Cette approche devra permettre de détecter et gérer plus efficacement les émergences d’espèces de Fusarium ou toute modification de la diversité du complexe Fusarium.
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Citer

Anne-Laure Boutigny, Angelique Gautier, Ryan Basler, Florian Dauthieux, Stephen Leite, et al.. Un outil moléculaire basé sur le séquençage haut débit pour caractériser les Fusarium sur céréales. Innovations Agronomiques, 2017, 59, pp.55-61. ⟨10.15454/1.513785287764323E12⟩. ⟨hal-01675815⟩
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