Cet article s’inscrit dans une réflexion d’abord méthodologique (mais en montrant les conséquences théoriques des choix faits lors de ces étapes) sur les premiers moments du travail sur les corpus, à partir de la sélection d’un logiciel d’aide à la transcription. L’interrogation majeure porte sur les enjeux et les incidences de ce que chacun des logiciels, par ses fonctionnalités propres, donne à voir du fonctionnement de l’oral, ou au contraire ne permet pas de montrer. Avec quelques exemples provenant d’un corpus recueilli en région parisienne, autour du discours rapporté, des particules et des chevauchements, l’objectif ultime est de montrer que cette phase initiale engage déjà toute une conception de la langue.