Can we trust untargeted metabolomics: first results of the metabo-ring study
Alexandre Verdu
(1)
,
Bernard Lyan
(2)
,
Carole Migné
(2)
,
Catherine Defoort
(3)
,
Cécile Canlet
(4)
,
Christophe Junot
(5)
,
Claude Guillou
(6)
,
Claudine Manach
(2)
,
Christophe Cordella
(7)
,
Daniel Jacob
(8)
,
Delphine Jouan-Rimbaud Bouveresse
(7)
,
Douglas Rutledge
(7)
,
Estelle Rathahao-Paris
(7)
,
Estelle Pujos-Guillot
(2)
,
Fabien Jourdan
(9)
,
Franck Giacomoni
(2)
,
Frédérique Courant
(10)
,
Gaëlle Fave
(3)
,
Gwanaelle Le Gall
(11)
,
Hubert Chassaigne
(6)
,
Jean-Charles Martin
(3, 12, 13)
,
Jean Claude Tabet
(14, 15)
,
Jean-Philippe Antignac
(10)
,
Laetitia Shintu
(16)
,
Marianne Defernez
(11)
,
Marie-Cécile Alexandre-Gouaubau
(16)
,
Marie Josephe Amiot-Carlin
(3)
,
Mathilde Bossis
(6)
,
Mathieu Maillot
(3)
,
Mohamed N. Triba
(17, 15)
,
Natali Stojilkovic
(18)
,
Nathalie Banzet
(19)
,
Roland Molinié
(20)
,
Romain Bott
(3)
,
Sophie Goulitquer
(21, 15)
,
Stefano Caldarelli
(16)
,
Thomas Moyon
(22)
1
Bruker
2 UNH - Unité de Nutrition Humaine
3 NORT - Nutrition, obésité et risque thrombotique
4 E20 - MetaToul AXIOM
5 LEMM - Laboratoire d'Etude du Métabolisme des Médicaments
6 Joint Research Centre - Institute for Health and Consumer Protection
7 GENIAL - Ingénierie Procédés Aliments
8 BFP - Biologie du fruit et pathologie
9 ToxAlim-MeX - Métabolisme et Xénobiotiques
10 LABERCA - Laboratoire d'étude des Résidus et Contaminants dans les Aliments
11 Institute of Food Research
12 INRA - Institut National de la Recherche Agronomique
13 INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale
14 IPCM - Institut Parisien de Chimie Moléculaire
15 CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique
16 ISM2 - Institut des Sciences Moléculaires de Marseille
17 CSPBAT - Chimie, Structures et Propriétés de Biomatériaux et d'Agents Thérapeutiques
18 LCH - Laboratoire des Courses Hippiques
19 TIMONE - Hôpital de la Timone [CHU - APHM]
20 BIOPI - Biologie des Plantes et Innovation - UR UPJV 3900
21 SBR - Station biologique de Roscoff = Roscoff Marine Station
22 PhAN - Physiopathologie des Adaptations Nutritionnelles
2 UNH - Unité de Nutrition Humaine
3 NORT - Nutrition, obésité et risque thrombotique
4 E20 - MetaToul AXIOM
5 LEMM - Laboratoire d'Etude du Métabolisme des Médicaments
6 Joint Research Centre - Institute for Health and Consumer Protection
7 GENIAL - Ingénierie Procédés Aliments
8 BFP - Biologie du fruit et pathologie
9 ToxAlim-MeX - Métabolisme et Xénobiotiques
10 LABERCA - Laboratoire d'étude des Résidus et Contaminants dans les Aliments
11 Institute of Food Research
12 INRA - Institut National de la Recherche Agronomique
13 INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale
14 IPCM - Institut Parisien de Chimie Moléculaire
15 CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique
16 ISM2 - Institut des Sciences Moléculaires de Marseille
17 CSPBAT - Chimie, Structures et Propriétés de Biomatériaux et d'Agents Thérapeutiques
18 LCH - Laboratoire des Courses Hippiques
19 TIMONE - Hôpital de la Timone [CHU - APHM]
20 BIOPI - Biologie des Plantes et Innovation - UR UPJV 3900
21 SBR - Station biologique de Roscoff = Roscoff Marine Station
22 PhAN - Physiopathologie des Adaptations Nutritionnelles
Carole Migné
- Fonction : Auteur
- PersonId : 737879
- IdHAL : carole-migne
- ORCID : 0000-0003-0907-2070
Cécile Canlet
- Fonction : Auteur
- PersonId : 747093
- IdHAL : cecile-canlet
- ORCID : 0000-0002-6389-0712
- IdRef : 235455504
Claudine Manach
- Fonction : Auteur
- PersonId : 736225
- IdHAL : claudine-manach
- ORCID : 0000-0003-1094-3363
- IdRef : 230917623
Daniel Jacob
- Fonction : Auteur
- PersonId : 171181
- IdHAL : daniel-jacob65
- ORCID : 0000-0002-6687-7169
- IdRef : 085566683
Delphine Jouan-Rimbaud Bouveresse
- Fonction : Auteur
- PersonId : 736758
- IdHAL : delphine-jouan-rimbaud-bouveresse
- ORCID : 0000-0003-0639-0911
Douglas Rutledge
- Fonction : Auteur
- PersonId : 744148
- IdHAL : douglas-rutledge
- ORCID : 0000-0001-5634-0766
- IdRef : 079255825
Estelle Rathahao-Paris
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1140507
- IdHAL : estelle-rathahao-paris
- ORCID : 0000-0002-7271-7372
Estelle Pujos-Guillot
- Fonction : Auteur
- PersonId : 741275
- IdHAL : estelle-pujos-guillot
- ORCID : 0000-0002-4693-5712
- IdRef : 08151557X
Fabien Jourdan
- Fonction : Auteur
- PersonId : 736810
- IdHAL : fabien-jourdan
- ORCID : 0000-0001-9401-2894
- IdRef : 069183996
Franck Giacomoni
- Fonction : Auteur
- PersonId : 181685
- IdHAL : giacomoni-franck
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- IdRef : 253126916
Frédérique Courant
- Fonction : Auteur
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- IdHAL : frederique-courant
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- IdRef : 079508480
Jean-Charles Martin
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1150743
- IdHAL : jcmartin
- ORCID : 0000-0002-2870-0012
Jean Claude Tabet
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1207512
- ORCID : 0000-0003-0080-2946
- IdRef : 070390991
Jean-Philippe Antignac
- Fonction : Auteur
- PersonId : 184906
- IdHAL : jean-philippe-antignac
- ORCID : 0000-0001-9512-9314
- IdRef : 060342528
Laetitia Shintu
- Fonction : Auteur
- PersonId : 766228
- ORCID : 0000-0003-2730-121X
- IdRef : 113464479
Marie Josephe Amiot-Carlin
- Fonction : Auteur
- PersonId : 735494
- IdHAL : mjamiot
- ORCID : 0000-0003-4563-4587
- IdRef : 094290555
Roland Molinié
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1138031
- IdHAL : roland-molinie
- ORCID : 0000-0003-4399-8838
- IdRef : 086832743
Thomas Moyon
- Fonction : Auteur
- PersonId : 737789
- IdHAL : thomas-moyon
- ORCID : 0000-0002-8308-8719
- IdRef : 253136024
Résumé
We designed a ring test to evaluate the convergence of the same biological information extracted from various NMR (n=4) and MS (4 QTOF and 4 orbitraps) in non-targeted metabolomics. The same rat plasma samples were analyzed by all the participants. Convergence within NMR (78 to 91%) were slightly better than within MS (57 to 87%). Convergence between NMR and MS was lower (37 to 87%). Improvement can be easily achieved by a tight standardization.