La modélisation explicitement spatiale est essentielle en écologie pour la prise de décision et de gestion. Elle implique la modélisation de l’hétérogénéité du paysage et le fait que différentes espèces d'agents peuvent se comporter à différentes échelles, ce qui accroît les besoins en matière de données, et oblige à leur intégration précise dans une hiérarchie imbriquée d’échelles spatio-temporelles (local / régional, saisonnier / pluriannuel, etc. . La modélisation multi-agents (MMA est un paradigme orienté « spatialement explicite » qui inclut l’hétérogénéité de l’espace (par exemple, des cultures, des prairies, des parcelles de forêt), où les individus (par exemple, les proies, les prédateurs, etc.) se déplacent représentés comme des « agents ». Ces derniers sont des entités autonomes, qui se déplacent dans l'espace virtuel et interagissent les uns avec les autres et les patchs environnementaux. Pendant la simulation, les dynamiques émergent et peuvent être observées et quantifiées. Ces modèles mettent en lumière les dynamiques microscopiques et spatiales qui ne peuvent être observés avec les modèles d’équation mathématiques classiques, (MME). Le couplage entre MMA et MME est cependant nécessaire pour éviter les limites de calcul lorsque des populations géantes (par exemple des centaines de millions d'individus) sont étudiées pour simuler des phénomènes écologiques tels que traités dans la Zone atelier Arc jurassien à propos des pullulations de campagnols. Les méthodes et résultats préliminaires de cette approche sont présentés ici.