Modelling and analysis of protein aggregation - Competing pathways in prion (PrP) polymerisation - Archive ouverte HAL Accéder directement au contenu
Communication Dans Un Congrès Année : 2014

Modelling and analysis of protein aggregation - Competing pathways in prion (PrP) polymerisation

Résumé

Protein aggregation leading to the formation of amyloid fibrils is involved in several neurodegenerative diseases such as prion diseases. To clarify how these fibrils are able to incorporate additional units, prion fibril aggregation and disaggregation kinetics were experimentally studied using Static Light Scattering (SLS). Values that are functions of the second order moment of c_i, with c_i being the concentration of fibrils of size i, were then measured as a function of time. An initial model, adapted from the Becker-Döring system that considers all fibrils to react similarly is not able to reproduce the observed in vitro behaviour. Our second model involves an additional compartment of fibrils unable to incorporate more prion units. This model leads to kinetic coefficien ts which are biologically plausible and correctly simulates the first experimental steps for prion aggregation.
L’agrégation des protéines conduisant à la formation de fibres amylöides est impliquée dans plusieurs maladies neurodégénératives telles que les maladies à prion. Pour clarifier la maniére dont les fibres de prion incorporent des unités supplémentaires, les cinétiques d’agrégation et de désagrégation des fibres ont été étudiées expérimentalement (par SLS, “Static Light Diffusion“). Ainsi des valeurs fonction du moment d'ordre deux des c_i, avec c_i la concentration en fibres de taille i ont été obtenues en fonction du temps. Un premier modèle, adapté du système de Becker-Döring, qui considère que la totalit ́e des fibres réagit de manière similaire ne permet pas de reproduire le comportement observé in vitro. Notre deuxième modèle met en jeu un compartiment additionnel de fibres incapables d’incorporer davantage d’unités de PrP. Celui-ci aboutit à des coefficients cinétiques biologiquement plausibles et simule correctement les premières étapes expérimentales de l’agrégation de prions.
Fichier principal
Vignette du fichier
proc144519.pdf (532.45 Ko) Télécharger le fichier
Origine Fichiers produits par l'(les) auteur(s)
Loading...

Dates et versions

hal-01082843 , version 1 (14-11-2014)

Licence

Identifiants

Citer

Hadjer Wafaa Haffaf, Stephanie Prigent. Modelling and analysis of protein aggregation - Competing pathways in prion (PrP) polymerisation. Congrès SMAI 2013, May 2013, Seignosse le Penon, France. ⟨10.1051/proc/201445019⟩. ⟨hal-01082843⟩
215 Consultations
132 Téléchargements

Altmetric

Partager

Gmail Mastodon Facebook X LinkedIn More