Les systèmes de polyculture élevage autonomes présentent de nombreux intérêts agro-écologiques. Cette étude vise à comprendre et formaliser le fonctionnement des systèmes de polyculture élevage autonomes, et leur construction progressive à partir de situations mobilisant des intrants externes. Nous analysons l'évolution des pratiques agricoles durant la transition selon le point de vue de l'agriculteur : nous la formalisons comme une transformation de l'activité de travail de l'agriculteur. Nous présentons l'analyse de 4 systèmes diversifiés de polyculture élevage ayant évolué vers l'autonomie. Les polyculteurs-éleveurs autonomes gèrnet de nouvelles entités, qui varient selon les agriculteurs : l'autonomie alimentaire du troupeau, l'autonomie en paille, la santé animale, l'équilibre alimentaire du troupeau...ils agissent en mobilisant de nouvelles connaissances, de nouveaux indicateurs acquis pas à pas durant la transition. Le développement de ces nouvelles façons de penser et d'agir a été réalisé en mobilisant différentes ressources, dont certaines sont communes aux 4 fermes étudiées. Malgré ces ressources partagées, le fonctionnement de ces 4 fermes est très singulier : cette singularité résulte de l'exigence de relocalisation de l'activité agricole dans ces systèmes. La relocalisation est basée sur la redécouverte et la mobilisation des ressources internes aux systèmes, sans recours aux intrants externes. La majorité des ressources internes sont situées aux interfaces entre cultures et élevage.