Thèse Année : 2005

Origin, evolution and assessment of groundwater biodiversity: molecular analysis of the genus Niphargus

Origine, évolution et mesure de la biodiversité des eaux souterraines : analyse moléculaire du genre Niphargus (Crustacea)

Résumé

Despite extreme conditions (darkness, oligotrophy, anoxia) groundwater is colonized by a rich fauna. Within the genus Niphargus (Crustacea, Amphipoda) and with molecular markers, this work tests the impact of convergence on biodiversity assessment. The influence of the habitat fragmentation and stability on the origin of this biodiversity are also analyzed. Results demonstrate significant biodiversity underestimation with classical taxonomy and highlight the importance of cryptic diversity. This work also supports the key evolutionary role of geographic isolation. To overcome cryptic diversity problems, a pragmatic approach based on molecular divergences is proposed.

Malgré des conditions de vie contraignantes (obscurité, oligotrophie, anoxie), les eaux souterraines abritent une faune très diversifiée. Au sein du genre Niphargus (Crustacea, Amphipoda) et à partir d'outils moléculaires, ce travail teste tout d'abord l'impact des phénomènes de convergence sur l'estimation de la biodiversité. Parallèlement, l'influence de la stabilité et de la forte fragmentation du milieu sur l'origine de cette biodiversité sont analysées. Les résultats démontrent une forte sous-estimation de la biodiversité par la taxonomie morpho-anatomique et soulignent l'importance de la diversité cachée. Ce travail soutient également le rôle central des isolements géographiques dans l'évolution des organismes et l'émergence d'un fort endémisme. Pour pallier les problèmes de diversité cachée, une approche pragmatique basée sur les divergences moléculaires entre taxons est proposée.

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Citer

Tristan Lefébure. Origine, évolution et mesure de la biodiversité des eaux souterraines : analyse moléculaire du genre Niphargus (Crustacea). Biodiversité et Ecologie. Université Claude Bernard Lyon 1, 2005. Français. ⟨NNT : 2005LYO10151⟩. ⟨tel-04833186⟩
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