Les micro-organismes eucaryotes, et en particulier les algues, jouent un rôle essentiel dans l'écosystème mondiale, en tant que producteurs primaires, dans le cycle des nutriments et à la base des réseaux alimentaires aquatiques. Les algues ont une histoire évolutive complexe et polyphylétique, due à l'acquisition endosymbiotique répétée de chloroplastes et des transferts horizontaux de gènes avec des partenaires algaux et bactériens dans les génomes nucléaires. Les algues les plus abondantes dans l'océan contemporain, telles que les dinoflagellés, les haptophytes et les diatomées, possèdent des chloroplastes originaires des endosymbioses secondaire ou supérieure d'algues rouges. Ces chloroplastes sont soutenus par des protéomes complexes codés par le noyau, qui peuvent être considérés comme des mosaïques définies à travers de l'histoire évolutive de l'hôte. Mon équipe étudie comment l'évolution horizontale des algues informe leur biologie fonctionnelle et leur écologie actuelle. Cela implique trois projets complémentaires : la reconstruction computationnelle des protéomes des chloroplastes d'algues encodés dans le noyau, avec une emphase sur les dinoflagellés ; la caractérisation expérimentale et environnementale de nouvelles protéines soutenant le chloroplaste des diatomées ; et l'évaluation phylogénétique des transferts horizontaux de gènes plus larges qui sous-tendent l'évolution des algues, avec un accent particulier sur les haptophytes et les espèces autochtones de l'océan Arctique. Enfin, je considère comment ces histoires et approches combinées peuvent s'entrelacer pour éclairer notre compréhension de la sensibilité et de la résilience des algues au changement climatique anthropique.