Le comptage de particules constitue un domaine métrologique particulièrement important dans le secteur biomédical. L'utilisation des ondes acoustiques présente divers intérêts par rapport aux méthodes classiques tels que leur innocuité vis-à-vis des milieux biologiques, la possibilité d'examen de suspensions optiquement opaques,... Dans ce travail, nous nous proposons d'évaluer une méthode de détection de particules par absorption d'ultrasons haute fréquence (autour de 100 MHz). Les résultats expérimentaux obtenus sur une culture de protozoaires sont présentés et comparés à ceux fournis par la simulation du signal échographique provenant d'une structure multi-couches modélisant une cellule biologique. Le modèle théorique est basé sur le formalisme des matrices de transfert et prend en compte l'atténuation dans les différentes couches constituant la structure.