Depuis les années 1960, les scientifiques utilisent la dynamique moléculaire pour comprendre le monde microscopique, en particulier le fascinant processus de repliement des protéines. Ce défi complexe, qui consiste à prédire comment une chaîne d'acides aminés trouve sa forme finale, a stimulé d'importantes innovations technologiques. Les années 2000 ont vu l'émergence des supercalculateurs dédiés comme Blue Gene d'IBM, suivis par le remarquable projet de science participative Folding@Home qui a mobilisé des ordinateurs personnels du monde entier. Un tournant majeur est survenu avec l'arrivée du supercalculateur Anton, spécialement conçu pour ces simulations, et l'utilisation des cartes graphiques (GPU) qui ont démocratisé le calcul haute performance. Plus récemment, l'intelligence artificielle a révolutionné le domaine, notamment avec AlphaFold2 de DeepMind et ESMFold de Meta, capables de prédire les structures protéiques avec une précision inédite. Ces avancées, couronnées par le prix Nobel de chimie 2024, ouvrent la voie à une nouvelle ère du calcul moléculaire, symbolisée par l'arrivée des calculateurs exaflopiques comme la future machine en France, promettant des découvertes encore plus spectaculaires dans notre compréhension du monde moléculaire.