Identification of new NMOSD and MOGAD genetic associations
Nicolas Vince
(1)
,
Irène Charles
(1)
,
Sonia Bourguiba-Hachemi
(1)
,
Sandra Vukusic
(2, 3, 4, 5)
,
Lakhdar Banyahya
(3, 5)
,
Françoise Durand-Dubief
(5, 3)
,
François Cotton
(6, 7)
,
Thi Hélène Zéphyr
(8, 9)
,
Elisabeth Maillart
(10, 11)
,
Caroline Papeix
(12, 10, 11)
,
Bertrand Audoin
(13, 14)
,
Xavier Ayrignac
(15, 16)
,
Bertrand Bourre
(17)
,
Jonathan Ciron
(18)
,
Mikael Cohen
(19, 20)
,
Nicolas Collongues
(21, 22)
,
Romain Deschamps
(12)
,
Aurélie Ruet
(23, 24)
,
Eric Thouvenot
(25, 26)
,
Romain Marignier
(2, 3, 4, 5)
,
Sophie Limou
(1)
,
Pierre-Antoine Gourraud
(1)
,
David‐axel Laplaud
(1)
1
U1064 Inserm - CR2TI -
Centre de Recherche en Transplantation et Immunologie - Center for Research in Transplantation and Translational Immunology
2 CRNL - Centre de recherche en neurosciences de Lyon - Lyon Neuroscience Research Center
3 Service de Neurologie [Lyon]
4 Fondation Eugène Devic EDMUS
5 Hôpital neurologique et neurochirurgical Pierre Wertheimer [CHU - HCL]
6 CHLS - Centre Hospitalier Lyon Sud [CHU - HCL]
7 CREATIS - Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé
8 LilNCog - Lille Neurosciences & Cognition - U 1172
9 CRC-SEP Nord-Pas de Calais - Centre de Ressources et de Compétences sur la Sclérose en Plaques (CRC-SEP) [Lille]
10 CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP]
11 MIRCEM - Centre de Référence des Maladies Inflammatoires Rares du Cerveau et de la Moelle
12 Hôpital Fondation Adolphe de Rothschild = Adolphe de Rothschild Foundation Hospital
13 INT - Institut de Neurosciences de la Timone
14 TIMONE - Hôpital de la Timone [CHU - APHM]
15 CHRU Montpellier - Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier]
16 INM - Institut des Neurosciences de Montpellier
17 CHU Rouen
18 CRC-SEP Toulouse - Centre Ressources et Compétences sclérose en plaques (CRC-SEP) [CHU Toulouse]
19 CHU Nice - Centre Hospitalier Universitaire de Nice
20 URRIS UR2CA - Unité de Recherche Clinique de la Côte d’Azur
21 Service de Neurologie [Strasbourg]
22 Centre d’Investigation Clinique Plurithématique (CIC - P) - CIC Strasbourg
23 U1215 Inserm - UB - Neurocentre Magendie : Physiopathologie de la Plasticité Neuronale
24 Service de neurologie [Bordeaux]
25 IGF - Institut de Génomique Fonctionnelle
26 Pôle NIRR - Service de Neurologie [CHU Nimes]
2 CRNL - Centre de recherche en neurosciences de Lyon - Lyon Neuroscience Research Center
3 Service de Neurologie [Lyon]
4 Fondation Eugène Devic EDMUS
5 Hôpital neurologique et neurochirurgical Pierre Wertheimer [CHU - HCL]
6 CHLS - Centre Hospitalier Lyon Sud [CHU - HCL]
7 CREATIS - Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé
8 LilNCog - Lille Neurosciences & Cognition - U 1172
9 CRC-SEP Nord-Pas de Calais - Centre de Ressources et de Compétences sur la Sclérose en Plaques (CRC-SEP) [Lille]
10 CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP]
11 MIRCEM - Centre de Référence des Maladies Inflammatoires Rares du Cerveau et de la Moelle
12 Hôpital Fondation Adolphe de Rothschild = Adolphe de Rothschild Foundation Hospital
13 INT - Institut de Neurosciences de la Timone
14 TIMONE - Hôpital de la Timone [CHU - APHM]
15 CHRU Montpellier - Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier]
16 INM - Institut des Neurosciences de Montpellier
17 CHU Rouen
18 CRC-SEP Toulouse - Centre Ressources et Compétences sclérose en plaques (CRC-SEP) [CHU Toulouse]
19 CHU Nice - Centre Hospitalier Universitaire de Nice
20 URRIS UR2CA - Unité de Recherche Clinique de la Côte d’Azur
21 Service de Neurologie [Strasbourg]
22 Centre d’Investigation Clinique Plurithématique (CIC - P) - CIC Strasbourg
23 U1215 Inserm - UB - Neurocentre Magendie : Physiopathologie de la Plasticité Neuronale
24 Service de neurologie [Bordeaux]
25 IGF - Institut de Génomique Fonctionnelle
26 Pôle NIRR - Service de Neurologie [CHU Nimes]
Nicolas Vince
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1131457
- IdHAL : nicolas-vince
- ORCID : 0000-0002-3767-6210
- IdRef : 147938937
Françoise Durand-Dubief
- Fonction : Auteur
- PersonId : 172702
- IdHAL : francoise-durand-dubief
- ORCID : 0000-0002-2860-1700
- IdRef : 15778911X
François Cotton
- Fonction : Auteur
- PersonId : 170687
- IdHAL : francois-cotton
- ORCID : 0000-0003-0046-2478
- IdRef : 070732035
Elisabeth Maillart
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1164214
- ORCID : 0000-0001-7699-0328
Bertrand Audoin
- Fonction : Auteur
- PersonId : 756934
- ORCID : 0000-0002-9860-7657
Xavier Ayrignac
- Fonction : Auteur
- PersonId : 773590
- ORCID : 0000-0003-3834-2981
- IdRef : 144729377
Jonathan Ciron
- Fonction : Auteur
- PersonId : 795646
- ORCID : 0000-0002-3386-6308
- IdRef : 137599021
Mikael Cohen
- Fonction : Auteur
- PersonId : 755337
- ORCID : 0000-0002-3985-1297
- IdRef : 14074116X
Nicolas Collongues
- Fonction : Auteur
- PersonId : 764750
- ORCID : 0000-0002-3683-5582
- IdRef : 129134465
Romain Deschamps
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1173910
- ORCID : 0000-0001-6291-8771
Aurélie Ruet
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1221381
- ORCID : 0000-0002-0020-8739
Eric Thouvenot
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1037455
- IdHAL : ericthouvenot
- ORCID : 0000-0001-8671-7747
- IdRef : 094970920
Romain Marignier
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1194084
- IdHAL : romain-marignier
- ORCID : 0000-0002-5967-2800
Sophie Limou
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1191789
- ORCID : 0000-0002-7702-8234
- IdRef : 146362705
Pierre-Antoine Gourraud
- Fonction : Auteur
- PersonId : 762977
- ORCID : 0000-0003-1131-9554
- IdRef : 195137280
David‐axel Laplaud
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1090012
- ORCID : 0000-0001-6113-6938
- IdRef : 081874901
Résumé
Introduction: Neuromyelitis Optica Spectrum Disorder (NMOSD) is a severe autoimmune demyelinating disease of the optic nerves and spinal cord affecting 0.4-4/100,000 individuals worldwide. Recently, an international consensus was reached to harmonize diagnosis criteria of neuroinflammatory diseases. The majority of patients with NMOSD are positive for a specific auto-antibody against the astrocytic aquaporin-4 (AQP4) water channel. A separate entity named MOGAD (MOG antibody-associated disease) groups patients with antibodies directed against the myelin oligodendrocyte glycoprotein (MOG). Two studies explored the genomic signature of NMOSD to date: 215 patients vs. 1244 controls from the USA and 203 patients vs. 1782 controls from Japan. They both found SNPs associated with NMOSD (AQP4) risk around HLA-DRB1 gene. However, only a few MOGAD patients were included in these GWASs, consequently, there is no formal GWAS about MOGAD to date.
Objectives/Aims: To identify new genetic associations with NMOSD and MOGAD patients.
Methods: DNA from 663 NMOSD and MOGAD patients (French NOMADMUS registry) was extracted and genotyped on the PMRA Affymetrix® Axiom chip (900k SNPs). After careful quality controls, we selected 656 patients with high-confidence genotypes.
Results: We analyzed the genetic structure using a principal component analysis (PCA) to determine the ancestry of our patients. We could determine that a majority of our samples were of European ancestry (70%). We restricted our study to this population as other ancestries did not bear enough samples to perform a sufficiently powered analysis. We performed a GWAS comparing these patients to 1544 controls from France. We identified a SNP within the HLA class II genomic region to be significantly associated with NMOSD (AQP4) patients (P=1.1x10-9, OR 3.3) which is in line with previous studies. In addition, we found a novel SNP close to the MAP3K7 gene in chromosome 6 showing a suggestive association with MOGAD patients (P=3.9x10-7, OR 3.1).
Conclusion: These preliminary results are very promising; however, additional analyses are needed to better describe these associations. We need to perform SNPs imputation to fine-map the genetic associations. We also need to impute the HLA to pinpoint associated HLA alleles, especially in NMOSD AQP4+ patients. This study is of great importance to better understand the genetic interplay between these neuroinflammatory diseases and find clues about their underlying pathophysiological mechanisms.