Comparaison de la qPCR et de la ddPCR pour détecter et surveiller la dynamique de la petite crevette rouge sang Hemimysis anomala et de son interaction avec la perche : une étude appliquée au Léman
Résumé
Les espèces exotiques envahissantes constituent une menace majeure pour les systèmes aquatiques en raison de leurs impacts potentiels sur la biodiversité endémique, le fonctionnement des écosystèmes, les infrastructures ou encore en raison d'éventuels problèmes sanitaires. L'obtention d'informations sur leur présence, leur abondance et leur répartition est toujours un enjeu clé. Récemment, la petite crevette rouge sang Hemimysis anomala, originaire de la région de Ponto Caspienne, s'est installée dans des lacs d'Europe occidentale tels que le Léman. Bien que les plongeurs aient signalé, à de nombreuses reprises, sa présence et son développement au cours de la dernière décennie, aucun suivi n'a encore été proposé pour ce petit crustacé. Nous avons testé et optimisé une approche ADNe en utilisant et en comparant deux techniques de PCR (PCR quantitative et PCR digitale) pour évaluer la présence, l'abondance et la dynamique de l'animal ainsi que celle d'un prédateur potentiel, la perche (Perca fluviatilis) pendant 2,5 ans. Nous montrons et discutons l'efficacité des méthodes et révélons pour la première fois la dynamique saisonnière d'Hemimysis anomala sur un site sélectionné dans le Léman. Nous soulignons, en accord avec les observations effectuées en plongée, que l'abondance de l'animal est élevée en hiver et diminue rapidement au début du printemps, de manière concomitante à l'augmentation de la température de l'eau et au « retour » visible des perches proches de la surface.
Mots clés
Domaines
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