Le but de ce travail a été d’explorer comment l’expression de gènes (transcriptomique) peut apporter des informations utiles dans la gestion des espèces d’intérêt aquacole (omble de fontaine Salvelinus fontinalis) et halieutique (le sébaste Atlantique Sébastes mentella). Un des aspects les plus importants dans la gestion des espèces est la compréhension de la croissance et du métabolisme, et les études au niveau moléculaire peuvent fournir des informations à un niveau de régulation très en amont des effets mesurables au niveau phénotypique. L’un des principaux apports de cette recherche a été de mettre en évidence les différences d’expression de gènes associées à la régulation de la croissance en fonction de la présence ou non de sélection génétique, de la famille et du phénotype chez l’omble de fontaine. Le rôle de certains gènes associés au contrôle de l’appétit et comment leur expression peut être associée à la performance individuelle et familiale est à souligner. Ces outils se sont également révélés utiles pour évaluer l’apport de la régulation hormonale et métabolique pour comparer la boucle de régulation de la croissance du sébaste atlantique, une espèce dont les conditions d’habitat (profondeur, pression, obscurité) sont difficiles à reproduire en milieu expérimental, à l’intérieur d’une vaste zone géographique couvrant l’estuaire et le golfe du Saint-Laurent.