Metabolomic prediction of breast cancer treatment induced neurological and metabolic toxicities
Max Piffoux
(1)
,
Jérémie Jacquemin
(2)
,
Mélanie Pétéra
(3)
,
Stephanie Durand
(3)
,
Angélique Abila
(3)
,
Delphine Centeno
(3)
,
Charlotte Joly
(3)
,
Bernard Lyan
(3)
,
Anne-Laure Martin
(4)
,
Sibille Everhard
(4)
,
Sandrine Boyault
(2)
,
Barbara Pistilli
(5)
,
Marion Fournier
(6)
,
Philippe Rouanet
(7)
,
Julie Havas
(5)
,
Baptiste Sauterey
(8)
,
Mario Campone
(8)
,
Carole Tarpin
(9)
,
Marie-Ange Mouret-Reynier
(10)
,
Olivier Rigal
(11)
,
Thierry Petit
(12)
,
Christine Lasset
(2)
,
Aurélie Bertaut
(13)
,
Paul Cottu
(14)
,
Fabrice Andre
(5)
,
Ines Vaz-Luis
(5)
,
Estelle Pujos-Guillot
(3)
,
Youenn Drouet
(2)
,
Olivier Trédan
(2)
1
HCL -
Hospices Civils de Lyon
2 Centre Léon Bérard [Lyon]
3 PFEM - Plateforme Exploration du Métabolisme
4 UNICANCER
5 IGR - Institut Gustave Roussy
6 Institut Bergonié [Bordeaux]
7 ICM - UNICANCER - Institut régional du Cancer Montpellier Val d'Aurelle
8 UNICANCER/ICO - Institut de Cancérologie de l'Ouest [Angers/Nantes]
9 IPC - Institut Paoli-Calmettes
10 UNICANCER/CJP - Centre Jean Perrin [Clermont-Ferrand]
11 CLCC Henri Becquerel - Centre de Lutte Contre le Cancer Henri Becquerel Normandie Rouen
12 ICANS - Institut de Cancérologie de Strasbourg Europe
13 Service d'oncogénétique [Centre georges-François Leclerc]
14 Curie Institute
2 Centre Léon Bérard [Lyon]
3 PFEM - Plateforme Exploration du Métabolisme
4 UNICANCER
5 IGR - Institut Gustave Roussy
6 Institut Bergonié [Bordeaux]
7 ICM - UNICANCER - Institut régional du Cancer Montpellier Val d'Aurelle
8 UNICANCER/ICO - Institut de Cancérologie de l'Ouest [Angers/Nantes]
9 IPC - Institut Paoli-Calmettes
10 UNICANCER/CJP - Centre Jean Perrin [Clermont-Ferrand]
11 CLCC Henri Becquerel - Centre de Lutte Contre le Cancer Henri Becquerel Normandie Rouen
12 ICANS - Institut de Cancérologie de Strasbourg Europe
13 Service d'oncogénétique [Centre georges-François Leclerc]
14 Curie Institute
Max Piffoux
- Fonction : Auteur
- PersonId : 793948
- ORCID : 0000-0002-7806-101X
- IdRef : 242429459
Jérémie Jacquemin
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1407542
- ORCID : 0009-0002-3035-0944
Mélanie Pétéra
- Fonction : Auteur
- PersonId : 742819
- IdHAL : melanie-petera
Stephanie Durand
- Fonction : Auteur
- PersonId : 736394
- IdHAL : stephanie-durand2
- ORCID : 0000-0002-9250-5537
- IdRef : 118436511
Angélique Abila
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1407543
- ORCID : 0009-0002-1429-6546
Delphine Centeno
- Fonction : Auteur
- PersonId : 754448
- IdHAL : dephine-centeno
- ORCID : 0000-0002-2747-6290
Charlotte Joly
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1142872
- IdHAL : charlotte-joly
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Bernard Lyan
- Fonction : Auteur
- PersonId : 754622
- IdHAL : bernard-lyan
- ORCID : 0009-0008-8777-5533
Sandrine Boyault
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1192549
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Barbara Pistilli
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1277737
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Marion Fournier
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1407544
- ORCID : 0009-0005-9092-3371
Philippe Rouanet
- Fonction : Auteur
- PersonId : 756875
- ORCID : 0000-0003-0415-3269
Julie Havas
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1407545
- ORCID : 0009-0001-5498-8574
Baptiste Sauterey
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1407546
- ORCID : 0000-0001-9160-7307
Mario Campone
- Fonction : Auteur
- PersonId : 761947
- ORCID : 0000-0002-5196-5908
- IdRef : 075165716
Carole Tarpin
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1407547
- ORCID : 0009-0003-9806-9662
Marie-Ange Mouret-Reynier
- Fonction : Auteur
- PersonId : 919130
- ORCID : 0000-0001-5542-5813
- IdRef : 142415146
Olivier Rigal
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1283655
- ORCID : 0000-0002-9206-847X
Thierry Petit
- Fonction : Auteur
- PersonId : 895122
- ORCID : 0000-0002-8746-0725
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Christine Lasset
- Fonction : Auteur
- PersonId : 934726
- IdHAL : christine-lasset
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Aurélie Bertaut
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1283652
- ORCID : 0000-0002-7934-9509
Paul Cottu
- Fonction : Auteur
- PersonId : 775421
- ORCID : 0000-0001-6434-3932
- IdRef : 273639056
Fabrice Andre
- Fonction : Auteur
- PersonId : 756940
- ORCID : 0000-0001-5795-8357
Ines Vaz-Luis
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1283663
- ORCID : 0000-0002-7194-2260
Estelle Pujos-Guillot
- Fonction : Auteur
- PersonId : 741275
- IdHAL : estelle-pujos-guillot
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- IdRef : 08151557X
Youenn Drouet
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1293175
- ORCID : 0000-0003-2963-558X
Olivier Trédan
- Fonction : Auteur
- PersonId : 767637
- ORCID : 0000-0001-5881-9383
Résumé
Abstract Background: Long-term treatment-related toxicities, such as neurological and metabolic toxicities, are major issues in breast cancer. We investigated the interest of metabolomic profiling to predict toxicities. Methods: Untargeted high-resolution metabolomic profiles of 992 patients with ER+/HER2- breast cancer from the prospective CANTO cohort were acquired (n=1935 metabolites). A residual-based modeling strategy with a discovery and validation cohort was used to benchmark machine learning algorithms, taking into account confounding variables. Results: Adaptive LASSO has a good predictive performance, has limited optimism bias, and allows the selection of metabolites of interest for future translational research. The addition of low-frequency metabolites and non-annotated metabolites increases the predictive power. Metabolomics adds extra performance to clinical variables to predict various neurological and metabolic toxicity profiles. Conclusions: Untargeted high-resolution metabolomics allows better toxicity prediction by considering environmental exposure, metabolites linked to microbiota, and low-frequency metabolites.