A Unix competency framework for learning bioinformatics
Une matrice de compétences Unix pour l’apprentissage de la bioinformatique
Abstract
Les avancées technologiques en biologie génèrent un flux important de données, nécessitant l'utilisation d'outils informatiques spécialisés, polyvalents et efficaces, intégrés à des infrastructures numériques collaboratives. Pour cela, les biologistes doivent acquérir un socle de compétences minimales en Unix afin d’effectuer des analyses et des traitements de données en bioinformatique. Pour faciliter l’apprentissage des compétences Unix en bioinformatique, nous proposons une approche pédagogique graduée et structurée via une matrice de compétence originale.
En s'appuyant sur le cadre conceptuel de la taxonomie de Bloom [1], nous avons conçu une matrice de compétences en Unix déclinée en niveaux de difficultés croissantes, structurés par groupes thématiques. Nous avons, par exemple, défini un premier groupe de compétences autour de la notion de commande Unix, et d’autres groupes de compétences autour de l'arborescence et de la manipulation de fichiers. Chaque compétence a été définie de manière opérationnelle en suivant la classification des objectifs d’apprentissage selon Bloom. Cette matrice s’adresse aux enseignants et formateurs en bioinformatique pour guider l’apprentissage et/ou pour évaluer le socle de compétences des apprenants. Elle est le fruit du travail collaboratif du groupe e-formation de l’IFB pendant 18 mois ; JOBIM 2024 sera l'occasion de la présenter pour la toute première fois à la communauté, et de recueillir les premiers retours.
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