Between but Not Within-Species Variation in the Distribution of Fitness Effects
Jennifer James
(1)
,
Chedly Kastally
(2)
,
Katharina B Budde
(3)
,
Santiago C. Gonzalez-Martinez
(4)
,
Pascal Milesi
(1)
,
Tanja Pyhäjärvi
(2)
,
Martin Lascoux
(1)
,
. Gentree Consortium
,
Paraskevi Alizoti
(5)
,
Ricardo Alía
(6)
,
Olivier Ambrosio
(7)
,
Filippos A Aravanopoulos
(5)
,
Georg von Arx
(8)
,
Audrey Albet
(9)
,
Francisco Auñón
(6)
,
Camilla Avanzi
(10)
,
Evangelia Avramidou
(5)
,
Francesca Bagnoli
(6)
,
Marko Bajc
(11)
,
Eduardo Ballesteros
(6)
,
Evangelos Barbas
(5)
,
José M García del Barrio
(6)
,
Cristina Bastias
(12)
,
Catherine Bastien
(13)
,
Giorgia Beffa
(8)
,
Raquel Benavides
(14)
,
Vanina Benoit
(15)
,
Frédéric Bernier
(9)
,
Henri Bignalet
(9)
,
Guillaume Bodineau
(16)
,
Damien Bouic
(6)
,
Sabine Brodbeck
(8)
,
William Brunetto
(7)
,
Jurata Buchovska
(17)
,
Corinne Buret
(15)
,
Melanie Buy
(18)
,
Ana M Cabanillas-Saldaña
(19)
,
Bárbara Carvalho
(14)
,
Stephen Cavers
(20)
,
Fernando del Caño
(6)
,
Sandra Cervantes
(21)
,
Nicolas Cheval
(9)
,
José M Climent
(6)
,
Marianne Correard
(22)
,
Eva Cremer
(23)
,
Darius Danusevičius
(17)
,
Benjamin Dauphin
(8)
,
Jean-Luc Denou
(9)
,
Bernard Dokhelar
(9)
,
Alexis Ducousso
(4)
,
Bruno Fady
(7)
,
Patricia Faivre-Rampant
(24)
,
Anna-Maria Farsakoglou
,
Patrick Fonti
,
Ioannis Ganopoulos
,
Olivier Gilg
(22)
,
Nicolas de Girardi
,
René Graf
,
Alan Gray
,
Delphine Grivet
,
Felix Gugerli
,
Christoph Hartleitner
,
Katrin Heer
,
Enja Hollenbach
,
Agathe Hurel
,
Bernard Issenhuth
,
Florence Jean
(7)
,
Véronique Jorge
,
Arnaud Jouineau
(7)
,
Jan-Philipp Kappner
,
Robert Kesälahti
,
Florian Knutzen
,
Sonja T Kujala
,
Timo A Kumpula
,
Katri Kärkkäinen
,
Mariaceleste Labriola
,
Celine Lalanne
,
Johannes Lambertz
,
Gregoire Le-Provost
,
Vincent Lejeune
,
Isabelle Lesur-Kupin
,
Joseph Levillain
,
Mirko Liesebach
,
David López-Quiroga
,
Ermioni Malliarou
,
Jérémy Marchon
,
Nicolas Mariotte
(7)
,
Antonio Mas
,
Silvia Matesanz
,
Benjamin Meier
,
Helge Meischner
,
Célia Michotey
,
Sandro Morganti
,
Tor Myking
,
Daniel Nievergelt
,
Anne Eskild Nilsen
,
Eduardo Notivol
,
Dario I Ojeda
,
Sanna Olsson
,
Lars Opgenoorth
,
Geir Ostreng
,
Birte Pakull
,
Annika Perry
,
Sara Pinosio
,
Andrea Piotti
,
Christophe Plomion
,
Nicolas Poinot
,
Mehdi Pringarbe
(22)
,
Luc Puzos
,
Annie Raffin
,
José A Ramírez-Valiente
,
Christian Rellstab
,
Dourthe Remi
,
Oliver Reutimann
,
Sebastian Richter
,
Juan J Robledo-Arnuncio
,
Odile Rogier
,
Elisabet Martínez Sancho
,
Outi Savolainen
,
Simone Scalabrin
,
Volker Schneck
,
Silvio Schueler
,
Ivan Scotti
(7)
,
Sergio San Segundo
,
Vladimir Semerikov
,
Lenka Slámová
,
Ilaria Spanu
,
Jørn Henrik Sønstebø
,
Jean Thevenet
(22)
,
Mari Mette Tollefsrud
,
Norbert Turion
(22)
,
Fernando Valladares
,
Giovanni G Vendramin
,
Marc Villar
,
Marjana Westergren
,
Johan Westin
1
Uppsala University
2 Helsingin yliopisto = Helsingfors universitet = University of Helsinki
3 Georg-August-University = Georg-August-Universität Göttingen
4 BioGeCo - Biodiversité, Gènes & Communautés
5 Aristotle University of Thessaloniki
6 INIA - Instituto Nacional de Innovación Agraria
7 URFM - Ecologie des Forêts Méditerranéennes
8 Swiss Federal Institute for Forest, Snow and Landscape Research WSL
9 UEFP - Unité expérimentale Forêt Pierroton
10 CNR - Consiglio Nazionale della Ricerche [Roma]
11 Slovenian Forestry Institute
12 CEFE - Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive
13 ECODIV - Département écologie et biodiversité des milieux forestiers, prairiaux et aquatiques
14 MNCN - Museo Nacional de Ciencias Naturales [Madrid]
15 BioForA - Biologie intégrée pour la valorisation de la diversité des Arbres et de la Forêt
16 GBFOR - Génétique et Biomasse Forestières ORléans
17 VDU - Vytautas Magnus University - Vytauto Didziojo Universitetas
18 URGI - Unité de Recherche Génomique Info
19 Departamento de Agricultura y Ganadería
20 UKCEH - UK Centre of Ecology and Hydrology
21 University of Oulu [Finland] = Oulun yliopisto [Suomi] = Université d'Oulu [Finlande]
22 UEFM - Unité Expérimentale Entomologie et Forêt Méditerranéenne
23 BAVARIAN FOREST INSTITUTE DEU
24 EPGV - Etude du Polymorphisme des Génomes Végétaux
2 Helsingin yliopisto = Helsingfors universitet = University of Helsinki
3 Georg-August-University = Georg-August-Universität Göttingen
4 BioGeCo - Biodiversité, Gènes & Communautés
5 Aristotle University of Thessaloniki
6 INIA - Instituto Nacional de Innovación Agraria
7 URFM - Ecologie des Forêts Méditerranéennes
8 Swiss Federal Institute for Forest, Snow and Landscape Research WSL
9 UEFP - Unité expérimentale Forêt Pierroton
10 CNR - Consiglio Nazionale della Ricerche [Roma]
11 Slovenian Forestry Institute
12 CEFE - Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive
13 ECODIV - Département écologie et biodiversité des milieux forestiers, prairiaux et aquatiques
14 MNCN - Museo Nacional de Ciencias Naturales [Madrid]
15 BioForA - Biologie intégrée pour la valorisation de la diversité des Arbres et de la Forêt
16 GBFOR - Génétique et Biomasse Forestières ORléans
17 VDU - Vytautas Magnus University - Vytauto Didziojo Universitetas
18 URGI - Unité de Recherche Génomique Info
19 Departamento de Agricultura y Ganadería
20 UKCEH - UK Centre of Ecology and Hydrology
21 University of Oulu [Finland] = Oulun yliopisto [Suomi] = Université d'Oulu [Finlande]
22 UEFM - Unité Expérimentale Entomologie et Forêt Méditerranéenne
23 BAVARIAN FOREST INSTITUTE DEU
24 EPGV - Etude du Polymorphisme des Génomes Végétaux
Santiago C. Gonzalez-Martinez
- Fonction : Auteur
- PersonId : 747477
- IdHAL : santiago-gonzalez-martinez
- ORCID : 0000-0002-4534-3766
Tanja Pyhäjärvi
- Fonction : Auteur
- PersonId : 808067
- ORCID : 0000-0001-6958-5172
Martin Lascoux
- Fonction : Auteur
- PersonId : 776779
- ORCID : 0000-0003-1699-9042
- IdRef : 165770821
. Gentree Consortium
- Fonction : Auteur
Cristina Bastias
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1410136
- ORCID : 0000-0002-2479-2001
William Brunetto
- Fonction : Auteur
- PersonId : 753364
- IdHAL : william-brunetto
Marianne Correard
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1206293
Bruno Fady
- Fonction : Auteur
- PersonId : 738874
- IdHAL : bruno-fady
- ORCID : 0000-0003-2379-7617
- IdRef : 080220967
Anna-Maria Farsakoglou
- Fonction : Auteur
Patrick Fonti
- Fonction : Auteur
Ioannis Ganopoulos
- Fonction : Auteur
Nicolas de Girardi
- Fonction : Auteur
René Graf
- Fonction : Auteur
Alan Gray
- Fonction : Auteur
Delphine Grivet
- Fonction : Auteur
Felix Gugerli
- Fonction : Auteur
Christoph Hartleitner
- Fonction : Auteur
Katrin Heer
- Fonction : Auteur
Enja Hollenbach
- Fonction : Auteur
Agathe Hurel
- Fonction : Auteur
Bernard Issenhuth
- Fonction : Auteur
Florence Jean
- Fonction : Auteur
- PersonId : 753356
- IdHAL : florence-jean-inrae
Véronique Jorge
- Fonction : Auteur
Arnaud Jouineau
- Fonction : Auteur
- PersonId : 753354
- IdHAL : arnaud-jouineau
Jan-Philipp Kappner
- Fonction : Auteur
Robert Kesälahti
- Fonction : Auteur
Florian Knutzen
- Fonction : Auteur
Sonja T Kujala
- Fonction : Auteur
Timo A Kumpula
- Fonction : Auteur
Katri Kärkkäinen
- Fonction : Auteur
Mariaceleste Labriola
- Fonction : Auteur
Celine Lalanne
- Fonction : Auteur
Johannes Lambertz
- Fonction : Auteur
Gregoire Le-Provost
- Fonction : Auteur
Vincent Lejeune
- Fonction : Auteur
Isabelle Lesur-Kupin
- Fonction : Auteur
Joseph Levillain
- Fonction : Auteur
Mirko Liesebach
- Fonction : Auteur
David López-Quiroga
- Fonction : Auteur
Ermioni Malliarou
- Fonction : Auteur
Jérémy Marchon
- Fonction : Auteur
Nicolas Mariotte
- Fonction : Auteur
- PersonId : 753350
- IdHAL : nicolas-mariotte
Antonio Mas
- Fonction : Auteur
Silvia Matesanz
- Fonction : Auteur
Benjamin Meier
- Fonction : Auteur
Helge Meischner
- Fonction : Auteur
Célia Michotey
- Fonction : Auteur
Sandro Morganti
- Fonction : Auteur
Tor Myking
- Fonction : Auteur
Daniel Nievergelt
- Fonction : Auteur
Anne Eskild Nilsen
- Fonction : Auteur
Eduardo Notivol
- Fonction : Auteur
Dario I Ojeda
- Fonction : Auteur
Sanna Olsson
- Fonction : Auteur
Lars Opgenoorth
- Fonction : Auteur
Geir Ostreng
- Fonction : Auteur
Birte Pakull
- Fonction : Auteur
Annika Perry
- Fonction : Auteur
Sara Pinosio
- Fonction : Auteur
Andrea Piotti
- Fonction : Auteur
Christophe Plomion
- Fonction : Auteur
Nicolas Poinot
- Fonction : Auteur
Mehdi Pringarbe
- Fonction : Auteur
- PersonId : 737681
- IdHAL : mehdi-pringarbe
Luc Puzos
- Fonction : Auteur
Annie Raffin
- Fonction : Auteur
José A Ramírez-Valiente
- Fonction : Auteur
Christian Rellstab
- Fonction : Auteur
Dourthe Remi
- Fonction : Auteur
Oliver Reutimann
- Fonction : Auteur
Sebastian Richter
- Fonction : Auteur
Juan J Robledo-Arnuncio
- Fonction : Auteur
Elisabet Martínez Sancho
- Fonction : Auteur
Outi Savolainen
- Fonction : Auteur
Simone Scalabrin
- Fonction : Auteur
Volker Schneck
- Fonction : Auteur
Silvio Schueler
- Fonction : Auteur
Ivan Scotti
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1193140
- IdHAL : ivanscotti
- ORCID : 0000-0002-8951-2680
Sergio San Segundo
- Fonction : Auteur
Vladimir Semerikov
- Fonction : Auteur
Lenka Slámová
- Fonction : Auteur
Ilaria Spanu
- Fonction : Auteur
Jørn Henrik Sønstebø
- Fonction : Auteur
Mari Mette Tollefsrud
- Fonction : Auteur
Fernando Valladares
- Fonction : Auteur
Giovanni G Vendramin
- Fonction : Auteur
Marc Villar
- Fonction : Auteur
Marjana Westergren
- Fonction : Auteur
Johan Westin
- Fonction : Auteur
Résumé
New mutations provide the raw material for evolution and adaptation. The distribution of fitness effects (DFE) describes the spectrum of effects of new mutations that can occur along a genome, and is, therefore, of vital interest in evolutionary biology. Recent work has uncovered striking similarities in the DFE between closely related species, prompting us to ask whether there is variation in the DFE among populations of the same species, or among species with different degrees of divergence, that is whether there is variation in the DFE at different levels of evolution. Using exome capture data from six tree species sampled across Europe we characterized the DFE for multiple species, and for each species, multiple populations, and investigated the factors potentially influencing the DFE, such as demography, population divergence, and genetic background. We find statistical support for the presence of variation in the DFE at the species level, even among relatively closely related species. However, we find very little difference at the population level, suggesting that differences in the DFE are primarily driven by deep features of species biology, and those evolutionarily recent events, such as demographic changes and local adaptation, have little impact.
Domaines
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