El desarrollo de las tecnologías digitales de las dos últimas décadas ha dado lugar a la generación de una enorme cantidad de datos y nuevas herramientas para tratarlos y servirse de ellos. Esto ha configurado un nuevo sistema sociotécnico que está transformando diversos aspectos de la vida, incluida la ciencia. Este artículo estudia la relación entre ciencia y big data, específicamente en las ciencias sociales en América Latina. Para esto usamos una metodología mixta que incluyó: 1) análisis bibliométrico para identificar a los principales autores y centros de investigación social sobre big data en América latina; 2) entrevistas semi-estructuradas con 100 de estos expertos para comprender en detalle su trayectoria académica, sus prácticas científicas y su percepción sobre las transformaciones en las ciencias sociales; y 3) etnografía de 18 meses en un laboratorio de investigación social y datos. Los resultados revelan un déficit en la capacitación para el uso de herramientas de big data y limitada accesibilidad a grandes bases de datos reales, generalmente controladas por grandes empresas o entidades públicas. Las colaboraciones interdisciplinarias muestran que existe una división tácita del trabajo científico en la cual los investigadores de ciencias “duras” tienden a asumir el trabajo directo con big data, mientras que los investigadores sociales se encargan del trabajo interpretativo y editorial. Finalmente, se observa una nueva forma de hacer ciencia que prioriza la resolución de problemas prácticos y la aplicación de metodologías, relegando las discusiones teóricas y epistemológicas. Estos resultados invitan a repensar el lugar del investigador social en los proyectos que usan big data.