Tara Pacific ITS2 Symbiodiniaceae data release version 1 - Archive ouverte HAL
Autre Publication Scientifique Année : 2020

Tara Pacific ITS2 Symbiodiniaceae data release version 1

Benjamin C.C. Hume (1) , Julie Poulain (2, 3, 4) , Stéphane Pesant , Caroline Belser (5) , Hans-Joachim Ruscheweyh (6) , Didier Forcioli (7, 8) , Eric Armstrong (9, 3, 10) , Quentin Clayssen (11) , Nicolas Henry (12) , Grace Klinges , Ryan Mcminds (7, 13, 14) , Lucas Paoli (15) , Claudia Pogoreutz (1, 16) , Guillem Salazar (6) , Maren Ziegler (17) , Clementine Moulin (18) , Emilie Boissin (10, 19) , Guillaume Bourdin (20) , Guillaume Iwankow (10) , Sarah Romac (21) , Sylvain Agostini (22) , Bernard Banaigs , Emmanuel Boss , Chris Bowler (3, 23) , Colomban de Vargas , Eric Douville , Michel Flores , Paola Furla , Pierre Galand (24, 25) , Eric Gilson , Fabien Lombard (26) , Stéphanie Reynaud , Matthew Sullivan , Olivier Thomas , Romain Troublé , Rebecca Vega Thurber , Didier Zoccola , Serge Planes , Denis Allemand , Shinichi Sunagawa , Patrick Wincker (9) , Christian Voolstra
1 RSRC - Red Sea Research Centre
2 JACOB - Institut de Biologie François JACOB
3 GOSEE - Global Oceans Systems Ecology & Evolution - Tara Oceans
4 LAGE - Laboratoire d'Analyses Génomiques des Eucaryotes
5 LBGB - Laboratoire de Bioinformatique pour la Génomique et la Biodiversité
6 D-BIOL - Department of Biology [ETH Zürich]
7 IRCAN - Institut de Recherche sur le Cancer et le Vieillissement
8 LIA ROPSE - Laboratoire International Associé Réponse des Organismes et Populations face au Stress Environnemental - Université Côte d’Azur - Centre Scientifique de Monaco
9 UMR 8030 - Génomique métabolique
10 CRIOBE - Centre de recherches insulaires et observatoire de l'environnement
11 GENOSCOPE - Genoscope - Centre national de séquençage [Evry]
12 CHU Angers - Centre Hospitalier Universitaire d'Angers
13 MSI - Maison de la Modélisation, de la Simulation et des Interactions [Sophia-Antipolis]
14 OSU - Oregon State University
15 Institute of Microbiology and Swiss Institute of Bioinformatics
16 University of Konstanz
17 JLU - Justus-Liebig-Universität Gießen = Justus Liebig University
18 Tara Expéditions
19 LabEX CORAIL - Laboratoire d'Excellence CORAIL
20 University of Maine
21 EPEP - Evolution des Protistes et Ecosystèmes Pélagiques
22 Shimoda Marine Research Center
23 IBENS - Institut de biologie de l'ENS Paris
24 LECOB - Laboratoire d'Ecogéochimie des environnements benthiques
25 LECOB - Laboratoire d'Ecogéochimie des environnements benthiques
26 LOV - Laboratoire d'océanographie de Villefranche
Benjamin C.C. Hume
Red Sea Research Centre
Julie Poulain
Institut de Biologie François JACOB
Global Oceans Systems Ecology & Evolution - Tara Oceans
Laboratoire d'Analyses Génomiques des Eucaryotes
Stéphane Pesant
Caroline Belser
Laboratoire de Bioinformatique pour la Génomique et la Biodiversité
CV
Hans-Joachim Ruscheweyh
Department of Biology [ETH Zürich]
Didier Forcioli
Institut de Recherche sur le Cancer et le Vieillissement
Laboratoire International Associé Réponse des Organismes et Populations face au Stress Environnemental - Université Côte d’Azur - Centre Scientifique de Monaco
Eric Armstrong
Génomique métabolique
Global Oceans Systems Ecology & Evolution - Tara Oceans
Centre de recherches insulaires et observatoire de l'environnement
Quentin Clayssen
  • Fonction : Auteur
Genoscope - Centre national de séquençage [Evry]
Nicolas Henry
Centre Hospitalier Universitaire d'Angers
Grace Klinges
  • Fonction : Auteur
Ryan Mcminds
Institut de Recherche sur le Cancer et le Vieillissement
Maison de la Modélisation, de la Simulation et des Interactions [Sophia-Antipolis]
Oregon State University
Lucas Paoli
Institute of Microbiology and Swiss Institute of Bioinformatics
Claudia Pogoreutz
Red Sea Research Centre
University of Konstanz
Guillem Salazar
Department of Biology [ETH Zürich]
Maren Ziegler
Justus-Liebig-Universität Gießen = Justus Liebig University
Clementine Moulin
  • Fonction : Auteur
Tara Expéditions
Emilie Boissin
Centre de recherches insulaires et observatoire de l'environnement
Laboratoire d'Excellence CORAIL
Guillaume Bourdin
University of Maine
Guillaume Iwankow
  • Fonction : Auteur
Centre de recherches insulaires et observatoire de l'environnement
Sarah Romac
  • Fonction : Auteur
Evolution des Protistes et Ecosystèmes Pélagiques
Sylvain Agostini
Shimoda Marine Research Center
Bernard Banaigs
Emmanuel Boss
Chris Bowler
Global Oceans Systems Ecology & Evolution - Tara Oceans
Institut de biologie de l'ENS Paris
CV
Colomban de Vargas
CV
Eric Douville
CV
Michel Flores
Paola Furla
Pierre Galand
Laboratoire d'Ecogéochimie des environnements benthiques
Laboratoire d'Ecogéochimie des environnements benthiques
Eric Gilson
Fabien Lombard
Laboratoire d'océanographie de Villefranche
CV
Stéphanie Reynaud
Matthew Sullivan
Olivier Thomas
Romain Troublé
  • Fonction : Auteur
Rebecca Vega Thurber
Didier Zoccola
Serge Planes
Denis Allemand
Shinichi Sunagawa
Patrick Wincker
Génomique métabolique
CV
Christian Voolstra

Résumé

This data is the result of the primary analysis of the Symbiodiniaceae ITS2 rDNA gene sequencing data collected from all islands as part of the Tara Pacific expedition.The analysis was conducted using SymPortal. A full README is contained within the data upload.

Domaines

Sciences du Vivant [q-bio]

Caroline Menguy  : Connectez-vous pour contacter le contributeur

https://hal.science/hal-04384112

Soumis le : mercredi 10 janvier 2024-08:48:44

Dernière modification le : jeudi 12 décembre 2024-03:47:11

Fichier non déposé

Dates et versions

hal-04384112 , version 1 (10-01-2024)

Identifiants

Citer

Benjamin C.C. Hume, Julie Poulain, Stéphane Pesant, Caroline Belser, Hans-Joachim Ruscheweyh, et al.. Tara Pacific ITS2 Symbiodiniaceae data release version 1. 2020, ⟨10.5281/zenodo.4061797⟩. ⟨hal-04384112⟩

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