Tara Pacific 18S-based coral host genetic analysis data release version 1 - Archive ouverte HAL
Autre Publication Scientifique Année : 2020

Tara Pacific 18S-based coral host genetic analysis data release version 1

Benjamin C.C. Hume (1) , Julie Poulain (2, 3) , Stéphane Pesant , Caroline Belser (4) , Hans-Joachim Ruscheweyh (5) , Emilie Boissin (6, 7) , Eric Armstrong (8, 2, 6) , Quentin Clayssen (9) , Nicolas Henry (10) , Grace Klinges , Ryan Mcminds (11, 12, 13) , Lucas Paoli (14) , Claudia Pogoreutz (1, 15) , Guillem Salazar (5) , Maren Ziegler (16) , Clementine Moulin (17) , Guillaume Bourdin (18) , Guillaume Iwankow (6) , Sarah Romac (19) , Sylvain Agostini (20) , Bernard Banaigs , Emmanuel Boss , Chris Bowler (2, 21) , Colomban de Vargas , Eric Douville , Michel Flores , Paola Furla , Pierre Galand (22, 23) , Eric Gilson , Fabien Lombard (24) , Stéphanie Reynaud , Matthew Sullivan , Shinichi Sunagawa , Olivier Thomas , Romain Troublé , Rebecca Vega Thurber , Didier Zoccola , Serge Planes , Denis Allemand , Didier Forcioli , Patrick Wincker , Christian Voolstra
1 RSRC - Red Sea Research Centre
2 GOSEE - Global Oceans Systems Ecology & Evolution - Tara Oceans
3 LAGE - Laboratoire d'Analyses Génomiques des Eucaryotes
4 LBGB - Laboratoire de Bioinformatique pour la Génomique et la Biodiversité
5 D-BIOL - Department of Biology [ETH Zürich]
6 CRIOBE - Centre de recherches insulaires et observatoire de l'environnement
7 LabEX CORAIL - Laboratoire d'Excellence CORAIL
8 UMR 8030 - Génomique métabolique
9 Ecole Polytechnique Fédérale de Zurich
10 CHU Angers - Centre Hospitalier Universitaire d'Angers
11 IRCAN - Institut de Recherche sur le Cancer et le Vieillissement
12 MSI - Maison de la Modélisation, de la Simulation et des Interactions [Sophia-Antipolis]
13 OSU - Oregon State University
14 Institute of Microbiology and Swiss Institute of Bioinformatics
15 University of Konstanz
16 JLU - Justus-Liebig-Universität Gießen = Justus Liebig University
17 Tara Expéditions
18 University of Maine
19 EPEP - Evolution des Protistes et Ecosystèmes Pélagiques
20 Shimoda Marine Research Center
21 IBENS - Institut de biologie de l'ENS Paris
22 LECOB - Laboratoire d'Ecogéochimie des environnements benthiques
23 LECOB - Laboratoire d'Ecogéochimie des environnements benthiques
24 LOV - Laboratoire d'océanographie de Villefranche
Benjamin C.C. Hume
Red Sea Research Centre
Julie Poulain
Global Oceans Systems Ecology & Evolution - Tara Oceans
Laboratoire d'Analyses Génomiques des Eucaryotes
Stéphane Pesant
Caroline Belser
Laboratoire de Bioinformatique pour la Génomique et la Biodiversité
CV
Hans-Joachim Ruscheweyh
Department of Biology [ETH Zürich]
Emilie Boissin
Centre de recherches insulaires et observatoire de l'environnement
Laboratoire d'Excellence CORAIL
Eric Armstrong
Génomique métabolique
Global Oceans Systems Ecology & Evolution - Tara Oceans
Centre de recherches insulaires et observatoire de l'environnement
Quentin Clayssen
  • Fonction : Auteur
Ecole Polytechnique Fédérale de Zurich
Nicolas Henry
Centre Hospitalier Universitaire d'Angers
Grace Klinges
  • Fonction : Auteur
Ryan Mcminds
Institut de Recherche sur le Cancer et le Vieillissement
Maison de la Modélisation, de la Simulation et des Interactions [Sophia-Antipolis]
Oregon State University
Lucas Paoli
Institute of Microbiology and Swiss Institute of Bioinformatics
Claudia Pogoreutz
Red Sea Research Centre
University of Konstanz
Guillem Salazar
Department of Biology [ETH Zürich]
Maren Ziegler
Justus-Liebig-Universität Gießen = Justus Liebig University
Clementine Moulin
  • Fonction : Auteur
Tara Expéditions
Guillaume Bourdin
University of Maine
Guillaume Iwankow
  • Fonction : Auteur
Centre de recherches insulaires et observatoire de l'environnement
Sarah Romac
  • Fonction : Auteur
Evolution des Protistes et Ecosystèmes Pélagiques
Sylvain Agostini
Shimoda Marine Research Center
Bernard Banaigs
Emmanuel Boss
Chris Bowler
Global Oceans Systems Ecology & Evolution - Tara Oceans
Institut de biologie de l'ENS Paris
CV
Colomban de Vargas
CV
Eric Douville
CV
Michel Flores
Paola Furla
Pierre Galand
Laboratoire d'Ecogéochimie des environnements benthiques
Laboratoire d'Ecogéochimie des environnements benthiques
Eric Gilson
Fabien Lombard
Laboratoire d'océanographie de Villefranche
CV
Stéphanie Reynaud
Matthew Sullivan
Shinichi Sunagawa
Olivier Thomas
Romain Troublé
  • Fonction : Auteur
Rebecca Vega Thurber
Didier Zoccola
Serge Planes
Denis Allemand
Didier Forcioli
Patrick Wincker
CV
Christian Voolstra

Résumé

This dataset contains 4 tables and 3 sets of figures related to the primary analysis of the 18S metabarcoding sequencing output. This dataset is only concerned with the identity of the coral host (i.e. not additional protist diversity). The samples included in this dataset have a 'sample-material_label' value of 'CORAL' and 'sampling-protocol_label' value of 'SEQ-CS4L'. They represent the coral samples collected at all 32 of the islands visited in the Tara Pacific expedition.

Domaines

Sciences du Vivant [q-bio]

Caroline Menguy  : Connectez-vous pour contacter le contributeur

https://hal.science/hal-04384097

Soumis le : mercredi 10 janvier 2024-08:33:43

Dernière modification le : lundi 9 décembre 2024-15:38:02

Fichier non déposé

Dates et versions

hal-04384097 , version 1 (10-01-2024)

Identifiants

Citer

Benjamin C.C. Hume, Julie Poulain, Stéphane Pesant, Caroline Belser, Hans-Joachim Ruscheweyh, et al.. Tara Pacific 18S-based coral host genetic analysis data release version 1. 2020, ⟨10.5281/zenodo.4265266⟩. ⟨hal-04384097⟩

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