Considerando o crescimento do uso de indicadores bibliométricos e cientométricos em processos de avaliação da Pós-Graduação brasileira, buscou-se identificar o nível de cobertura da Web of Science em relação à produção bibliográfica brasileira (artigos) nas diferentes Grandes Áreas do Conhecimento e Áreas de Avaliação da Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, agência pública brasileira de financiamento à pesquisa, apontando limites e possibilidades da adoção desses indicadores como mecanismos de avaliação dos resultados da atividade científica dos programas que compõem o Sistema Nacional de Pós-Graduação. Para tanto, recorreu-se ao levantamento de dados da produção bibliográfica dos 4.377 Programas de Pós-Graduação cadastrados na Plataforma Sucupira nos anos de 2017 e 2018, bem como à coleta de dados da Core Collection da Web of Science. Diante dos dados empíricos e do referencial teórico adotado, evidenciou-se que 46,56% dos periódicos utilizados para publicação por pesquisadores vinculados aos Programas de Pós-Graduação brasileiros estão indexados na base, enquanto 53,44% dos periódicos utilizados não estão indexados. Demonstrou-se variações de cobertura/indexação nas diferentes Grandes Áreas do Conhecimento e Áreas de Avaliação, assim como abordou-se a necessidade de se considerar, em processos de avaliação de Programas de Pós-Graduação, os resultados das atividades científicas para além da produção bibliográfica de artigos indexados em bases bibliográficas internacionais.