Mission Tara Microplastics: a holistic set of protocols and data resources for the field investigation of plastic pollution along the land-sea continuum in Europe
Jean-François Ghiglione
(1)
,
Valérie Barbe
(2)
,
Stéphane Bruzaud
(3)
,
Gaëtan Burgaud
(4)
,
Jérôme Cachot
(5)
,
Boris Eyheraguibel
(6)
,
Franck Lartaud
(7)
,
Wolfgang Ludwig
(8, 9)
,
Anne-Leila Meistertzheim
(10)
,
Ika Paul-Pont
(11)
,
Stéphane Pesant
(12)
,
Alexandra ter Halle
(13, 14, 15)
,
Odon Thiebeauld
(16)
,
Jean-François F Ghiglione
(1)
,
L. Philip
,
C. Odobel
,
C. Pandin
,
M. Pujo-Pay
(1)
,
P. Conan
(1)
,
N. Luckas
,
Valérie Barbe
(17)
,
P. Wincker
(18)
,
Stéphane Bruzaud
(3)
,
M. Kedzierski
(3)
,
M. Palazot
,
L. Soccalingame
,
Gaëtan Burgaud
(4)
,
Jérôme Cachot
(5)
,
B. Morin
(19)
,
E. Dusacre
,
C. Clérandeau
(5)
,
C. Lefebvre
(20)
,
Boris Eyheraguibel
(6)
,
Franck Lartaud
(7)
,
Wolfgang Ludwig
(8)
,
X. Durrieu de Madron
,
L. Weiss
(21, 22, 23)
,
Anne-Leila L Meistertzheim
(10)
,
I. Calves
,
K. Lebaron
,
E. Lavergne
(11, 24, 25, 26)
,
Ika Paul-Pont
(11)
,
A. Huvet
(27, 28)
,
C. Dubreuil
(29)
,
Stéphane Pesant
(12)
,
Alexandra ter Halle
(13)
,
M. Albignac
(13, 30)
,
Odon Thiebeauld
(16)
,
K. Crenn
,
T. Gassane
,
L. Merakeb
,
C. Bauvois
,
F. Galgani
(28)
,
O. Gerigny
(28)
,
M L Pedrotti
(31)
,
G. Gorsky
(32)
,
F. Lombard
(32, 33)
,
S. Alligant
,
C. Lacroix
,
Lionel Navarro
,
B. Sperandio
,
B. Diémé
,
C. Bowler
,
R. Troublé
,
R. Hentinger
,
A. Abreu
,
M. Thomas
,
M. Bourdreux
,
J. Schramm
,
C. Moulin
,
E. Bernollin
,
M. Hertau
,
S. Audrain
,
N. Bin
,
Y. Tournon
,
L. Boulon
,
F. Aurat
,
L. Blijdorp
,
C. Pire
,
S. Bin
,
C. Gicquel
(34)
,
M. Oriot
1
LOMIC -
Laboratoire d'Océanographie Microbienne
2 UMR 8030 - Génomique métabolique
3 IRDL - Institut de Recherche Dupuy de Lôme
4 LUBEM - Laboratoire Universitaire de Biodiversité et Ecologie Microbienne
5 EPOC - Environnements et Paléoenvironnements OCéaniques
6 ICCF - Institut de Chimie de Clermont-Ferrand
7 LECOB - Laboratoire d'Ecogéochimie des environnements benthiques
8 ESRF - European Synchrotron Radiation Facility
9 CEFREM - Centre de Formation et de Recherche sur les Environnements Méditérranéens
10 OOB - Observatoire océanologique de Banyuls
11 LEMAR - Laboratoire des Sciences de l'Environnement Marin (LEMAR)
12 EMBL-EBI - European Bioinformatics Institute [Hinxton]
13 IMRCP - Interactions moléculaires et réactivité chimique et photochimique
14 Softmat - Chimie des colloïdes, polymères & assemblages complexes
15 SMODD - Systèmes Moléculaires Organisés et Développement Durable
16 IBMP - Institut de Biologie Moléculaire des Plantes
17 GENOSCOPE - Genoscope - Centre national de séquençage [Evry]
18 JACOB - Institut de Biologie François JACOB
19 AIM (UMR7158 / UMR_E_9005 / UM_112) - Astrophysique Interprétation Modélisation
20 CHU Bordeaux - Centre Hospitalier Universitaire de Bordeaux
21 IRSL - Institut de Recherche Saint-Louis - Hématologie Immunologie Oncologie (Département de recherche de l’UFR de médecine ; ex- Institut Universitaire Hématologie-IUH)
22 HEGP - Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP]
23 UPD5 Médecine - Université Paris Descartes - Faculté de Médecine
24 SGN - Forschungsinstitut Senckenberg
25 SBiK-F - Senckenberg Biodiversity and Climate Research Centre
26 Kyoto University
27 UBO - Université de Brest
28 IFREMER - Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer
29 Ministère de l'Alimentation, de l'Agriculture et de la Pêche [Paris, France]
30 IMRCP - SMODD - IMRCP - Systèmes Moléculaires Organisés et Développement Durable
31 UNITO - Università degli studi di Torino = University of Turin
32 LOV - Laboratoire d'océanographie de Villefranche
33 IUF - Institut universitaire de France
34 STCP - Service de Technologie des Composants et des Procédés
2 UMR 8030 - Génomique métabolique
3 IRDL - Institut de Recherche Dupuy de Lôme
4 LUBEM - Laboratoire Universitaire de Biodiversité et Ecologie Microbienne
5 EPOC - Environnements et Paléoenvironnements OCéaniques
6 ICCF - Institut de Chimie de Clermont-Ferrand
7 LECOB - Laboratoire d'Ecogéochimie des environnements benthiques
8 ESRF - European Synchrotron Radiation Facility
9 CEFREM - Centre de Formation et de Recherche sur les Environnements Méditérranéens
10 OOB - Observatoire océanologique de Banyuls
11 LEMAR - Laboratoire des Sciences de l'Environnement Marin (LEMAR)
12 EMBL-EBI - European Bioinformatics Institute [Hinxton]
13 IMRCP - Interactions moléculaires et réactivité chimique et photochimique
14 Softmat - Chimie des colloïdes, polymères & assemblages complexes
15 SMODD - Systèmes Moléculaires Organisés et Développement Durable
16 IBMP - Institut de Biologie Moléculaire des Plantes
17 GENOSCOPE - Genoscope - Centre national de séquençage [Evry]
18 JACOB - Institut de Biologie François JACOB
19 AIM (UMR7158 / UMR_E_9005 / UM_112) - Astrophysique Interprétation Modélisation
20 CHU Bordeaux - Centre Hospitalier Universitaire de Bordeaux
21 IRSL - Institut de Recherche Saint-Louis - Hématologie Immunologie Oncologie (Département de recherche de l’UFR de médecine ; ex- Institut Universitaire Hématologie-IUH)
22 HEGP - Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP]
23 UPD5 Médecine - Université Paris Descartes - Faculté de Médecine
24 SGN - Forschungsinstitut Senckenberg
25 SBiK-F - Senckenberg Biodiversity and Climate Research Centre
26 Kyoto University
27 UBO - Université de Brest
28 IFREMER - Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer
29 Ministère de l'Alimentation, de l'Agriculture et de la Pêche [Paris, France]
30 IMRCP - SMODD - IMRCP - Systèmes Moléculaires Organisés et Développement Durable
31 UNITO - Università degli studi di Torino = University of Turin
32 LOV - Laboratoire d'océanographie de Villefranche
33 IUF - Institut universitaire de France
34 STCP - Service de Technologie des Composants et des Procédés
Jean-François Ghiglione
- Fonction : Auteur
- PersonId : 854555
- ORCID : 0000-0001-7475-2262
- IdRef : 147033780
Valérie Barbe
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1187196
- IdHAL : valerie-barbe
- ORCID : 0000-0002-8162-3343
Gaëtan Burgaud
- Fonction : Auteur
- PersonId : 772157
- IdHAL : gaetan-burgaud
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Jérôme Cachot
- Fonction : Auteur
- PersonId : 773051
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Franck Lartaud
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1221077
- IdHAL : franck-lartaud
- ORCID : 0000-0001-7130-2944
Ika Paul-Pont
- Fonction : Auteur
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- IdHAL : ika-paul-pont
- ORCID : 0000-0003-3734-0909
- IdRef : 14333820X
Alexandra ter Halle
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1158111
- IdHAL : alexandra-ter-halle
- ORCID : 0000-0001-7065-2272
- IdRef : 169998495
L. Philip
- Fonction : Auteur
C. Odobel
- Fonction : Auteur
C. Pandin
- Fonction : Auteur
N. Luckas
- Fonction : Auteur
P. Wincker
- Fonction : Auteur
- PersonId : 757160
- IdHAL : patrick-wincker
- ORCID : 0000-0001-7562-3454
M. Palazot
- Fonction : Auteur
L. Soccalingame
- Fonction : Auteur
E. Dusacre
- Fonction : Auteur
X. Durrieu de Madron
- Fonction : Auteur
I. Calves
- Fonction : Auteur
K. Lebaron
- Fonction : Auteur
E. Lavergne
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1918
- IdHAL : edouardlavergne
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Ika Paul-Pont
- Fonction : Auteur
- PersonId : 179627
- IdHAL : ika-paul-pont
- ORCID : 0000-0003-3734-0909
- IdRef : 14333820X
M. Albignac
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1254459
- ORCID : 0000-0001-6083-7599
K. Crenn
- Fonction : Auteur
T. Gassane
- Fonction : Auteur
L. Merakeb
- Fonction : Auteur
C. Bauvois
- Fonction : Auteur
S. Alligant
- Fonction : Auteur
C. Lacroix
- Fonction : Auteur
Lionel Navarro
- Fonction : Auteur
- PersonId : 181008
- IdHAL : lionel-navarro
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B. Sperandio
- Fonction : Auteur
B. Diémé
- Fonction : Auteur
C. Bowler
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1228231
- IdHAL : chris-bowler
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- IdRef : 06874904X
R. Troublé
- Fonction : Auteur
R. Hentinger
- Fonction : Auteur
A. Abreu
- Fonction : Auteur
M. Thomas
- Fonction : Auteur
M. Bourdreux
- Fonction : Auteur
J. Schramm
- Fonction : Auteur
C. Moulin
- Fonction : Auteur
E. Bernollin
- Fonction : Auteur
M. Hertau
- Fonction : Auteur
S. Audrain
- Fonction : Auteur
N. Bin
- Fonction : Auteur
Y. Tournon
- Fonction : Auteur
F. Aurat
- Fonction : Auteur
L. Blijdorp
- Fonction : Auteur
C. Pire
- Fonction : Auteur
S. Bin
- Fonction : Auteur
M. Oriot
- Fonction : Auteur
Résumé
The Tara Microplastics mission was conducted for 7 months to investigate plastic pollution along nine major rivers in Europe-Thames, Elbe, Rhine, Seine, Loire, Garonne, Ebro, Rhone, and Tiber. An extensive suite of sampling protocols was applied at four to five sites on each river along a salinity gradient from the sea and the outer estuary to downstream and upstream of the first heavily populated city. Biophysicochemical parameters including salinity, temperature, irradiance, particulate matter, large and small microplastics (MPs) concentration and composition, prokaryote and microeukaryote richness, and diversity on MPs and in the surrounding waters were routinely measured onboard the French research vessel Tara or from a semi-rigid boat in shallow waters. In addition, macroplastic and microplastic concentrations and composition were determined on river banks and beaches. Finally, cages containing either pristine pieces of plastics in the form of films or granules, and others containing mussels were immersed at each sampling site, 1 month prior to sampling in order to study the metabolic activity of the plastisphere by meta-OMICS and to run toxicity tests and pollutants analyses. Here, we fully described the holistic set of protocols designed for the Mission Tara Microplastics and promoted standard procedures to achieve its ambitious goals: (1) compare traits of plastic pollution among European rivers, (2) provide a baseline of the state of plastic pollution in the Anthropocene, (3) predict their evolution in the frame of the current European initiatives, (4) shed light on the toxicological effects of plastic on aquatic life, (5) model the transport of microplastics from land towards the sea, and (6) investigate the potential impact of pathogen or invasive species rafting on drifting plastics from the land to the sea through riverine systems.
Fichier principal
Ghiglione et al. 2023_Mission Tara Microplastics methods.pdf (1.99 Mo)
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