Top-Down Proteoform Analysis by 2D MS with Quadrupolar Detection - Archive ouverte HAL Accéder directement au contenu
Article Dans Une Revue Analytical Chemistry Année : 2023

Top-Down Proteoform Analysis by 2D MS with Quadrupolar Detection

Analyse descendante en 2D MS avec une détection quadrupolaire

Marek Polák
  • Fonction : Auteur
Michael Palasser
  • Fonction : Auteur
Alan Kádek
  • Fonction : Auteur
Daniel Kavan
  • Fonction : Auteur
Christopher Wootton
  • Fonction : Auteur
Marc-André Delsuc
Kathrin Breuker
Petr Novák

Résumé

Two-dimensional mass spectrometry (2D MS) is a multiplexed tandem mass spectrometry method that does not rely on ion isolation to correlate precursor and fragment ions. On a Fourier transform ion cyclotron resonance mass spectrometer (FT-ICR MS), 2D MS instead uses the modulation of precursor ion radii inside the ICR cell before fragmentation and yields 2D mass spectra which show the fragmentation patterns of all the analytes. In this study, we perform 2D MS for the first time with quadrupolar detection in a dynamically harmonized ICR cell. We discuss the advantages of quadrupolar detection in 2D MS and how we adapted existing data processing techniques for accurate frequency-to-mass conversion. We apply 2D MS with quadrupolar detection to the top-down analysis of covalently labelled ubiquitin with ECD fragmentation and we develop a workflow for label-free relative quan- tification of biomolecule isoforms in 2D MS.

Domaines

Chimie
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Origine : Fichiers produits par l'(les) auteur(s)

Dates et versions

hal-04263715 , version 1 (29-10-2023)

Identifiants

Citer

Marek Polák, Michael Palasser, Alan Kádek, Daniel Kavan, Christopher Wootton, et al.. Top-Down Proteoform Analysis by 2D MS with Quadrupolar Detection. Analytical Chemistry, 2023, ⟨10.1021/acs.analchem.3c02225⟩. ⟨hal-04263715⟩
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