Principles and contributions of molecular networking in clinical and forensic toxicology
Principes et contributions de la mise en réseau moléculaire en toxicologie clinique et médico-légale]
Résumé
La spectrométrie de masse haute résolution (HRMS) a constitué une grande avancée pour la toxicologie analytique, permettant l’acquisition d’un grand nombre de données avec une grande précision. Cependant, le retraitement bio-informatique de ces données est parfois limitant et verrouillé par le logiciel commercial du fournisseur. La construction d’un réseau moléculaire fait appel à des outils bio-informatiques permettant le retraitement des données de spectrométrie de masse à l’aide de logiciels en accès libre et de regrouper de manière visuelle les molécules structurellement proches au sein d’échantillons. À partir des données brutes acquises par HRMS, plusieurs outils permettent ainsi de filtrer, puis retraiter ces données enfin d’être lues sur un logiciel graphique. Au-delà de l’annotation facilitée de composés connus au sein d’un échantillon complexe, cette méthodologie permet également d’identifier de nouveaux métabolites de xénobiotiques, ouvrant de nombreuses perspectives en toxicologie clinique et médicolégale. Nous présentons ici la méthodologie à adopter pour la réalisation de réseaux moléculaires ainsi que son apport en toxicologie hospitalière.
Domaines
Sciences du Vivant [q-bio]
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Licence : CC BY NC - Paternité - Pas d'utilisation commerciale
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