Ecology of Endozoicomonadaceae in three coral genera across the Pacific Ocean - Archive ouverte HAL
Article Dans Une Revue Nature Communications Année : 2023

Ecology of Endozoicomonadaceae in three coral genera across the Pacific Ocean

Corentin Hochart (1) , Lucas Paoli (2) , Hans-Joachim Ruscheweyh (3) , Guillem Salazar (3) , Emilie Boissin (4) , Sarah Romac (5, 6) , Julie Poulain (5, 7) , Guillaume Bourdin (8) , Guillaume Iwankow (4) , Clémentine Moulin (9) , Maren Ziegler (10) , Barbara Porro (11, 12) , Eric Armstrong (7, 5, 4) , Benjamin Hume (13) , Jean-Marc Aury (14, 5) , Claudia Pogoreutz (15) , David Paz-García , Maggy Nugues (16, 4) , Sylvain Agostini (17) , Bernard Banaigs , Emmanuel Boss (8) , Chris Bowler (5, 18) , Colomban de Vargas , Éric Douville (19, 20) , Michel Flores , Didier Forcioli , Paola Furla , Eric Gilson , Fabien Lombard (21) , Stéphane Pesant , Stéphanie Reynaud , Olivier Thomas , Romain Troublé , Patrick Wincker (7) , Didier Zoccola , Denis Allemand , Serge Planes , Rebecca Vega Thurber , Christian Voolstra , Shinichi Sunagawa , Pierre Galand (22)
1 UCA [2017-2020] - Université Clermont Auvergne [2017-2020]
2 Institute of Microbiology and Swiss Institute of Bioinformatics
3 D-BIOL - Department of Biology [ETH Zürich]
4 CRIOBE - Centre de recherches insulaires et observatoire de l'environnement
5 GOSEE - Global Oceans Systems Ecology & Evolution - Tara Oceans
6 SBR - Station biologique de Roscoff = Roscoff Marine Station
7 UMR 8030 - Génomique métabolique
8 University of Maine
9 Fondation Tara Ocean
10 JLU - Justus-Liebig-Universität Gießen = Justus Liebig University
11 UMR MARBEC - MARine Biodiversity Exploitation and Conservation
12 IRCAN - Institut de Recherche sur le Cancer et le Vieillissement
13 Universität Konstanz
14 LBGB - Laboratoire de Bioinformatique pour la Génomique et la Biodiversité
15 KAUST - King Abdullah University of Science and Technology [Saudi Arabia]
16 LabEX CORAIL - Laboratoire d'Excellence CORAIL
17 Shimoda Marine Research Center
18 IBENS - Institut de biologie de l'ENS Paris
19 LSCE - Laboratoire des Sciences du Climat et de l'Environnement [Gif-sur-Yvette]
20 GEOTRAC - Géochrononologie Traceurs Archéométrie
21 LOV - Laboratoire d'océanographie de Villefranche
22 LECOB - Laboratoire d'Ecogéochimie des environnements benthiques
Corentin Hochart
Université Clermont Auvergne [2017-2020]
Lucas Paoli
Institute of Microbiology and Swiss Institute of Bioinformatics
Hans-Joachim Ruscheweyh
Department of Biology [ETH Zürich]
Guillem Salazar
Department of Biology [ETH Zürich]
Emilie Boissin
Centre de recherches insulaires et observatoire de l'environnement
Sarah Romac
  • Fonction : Auteur
Global Oceans Systems Ecology & Evolution - Tara Oceans
Station biologique de Roscoff = Roscoff Marine Station
Julie Poulain
Global Oceans Systems Ecology & Evolution - Tara Oceans
Génomique métabolique
Guillaume Bourdin
University of Maine
Guillaume Iwankow
  • Fonction : Auteur
Centre de recherches insulaires et observatoire de l'environnement
Clémentine Moulin
  • Fonction : Auteur
Fondation Tara Ocean
Maren Ziegler
  • Fonction : Auteur
Justus-Liebig-Universität Gießen = Justus Liebig University
Barbara Porro
  • Fonction : Auteur
MARine Biodiversity Exploitation and Conservation
Institut de Recherche sur le Cancer et le Vieillissement
Eric Armstrong
Génomique métabolique
Global Oceans Systems Ecology & Evolution - Tara Oceans
Centre de recherches insulaires et observatoire de l'environnement
Benjamin Hume
  • Fonction : Auteur
Universität Konstanz
Jean-Marc Aury
Laboratoire de Bioinformatique pour la Génomique et la Biodiversité
Global Oceans Systems Ecology & Evolution - Tara Oceans
CV
Claudia Pogoreutz
King Abdullah University of Science and Technology [Saudi Arabia]
David Paz-García
  • Fonction : Auteur
Maggy Nugues
Laboratoire d'Excellence CORAIL
Centre de recherches insulaires et observatoire de l'environnement
Sylvain Agostini
Shimoda Marine Research Center
Bernard Banaigs
  • Fonction : Auteur
Emmanuel Boss
University of Maine
Chris Bowler
Global Oceans Systems Ecology & Evolution - Tara Oceans
Institut de biologie de l'ENS Paris
CV
Colomban de Vargas
CV
Éric Douville
Laboratoire des Sciences du Climat et de l'Environnement [Gif-sur-Yvette]
Géochrononologie Traceurs Archéométrie
CV
Michel Flores
Didier Forcioli
Paola Furla
Eric Gilson
Fabien Lombard
Laboratoire d'océanographie de Villefranche
CV
Stéphane Pesant
  • Fonction : Auteur
Stéphanie Reynaud
Olivier Thomas
  • Fonction : Auteur
Romain Troublé
Patrick Wincker
Génomique métabolique
CV
Didier Zoccola
Denis Allemand
Serge Planes
  • Fonction : Auteur
Rebecca Vega Thurber
Christian Voolstra
Shinichi Sunagawa
Pierre Galand
Laboratoire d'Ecogéochimie des environnements benthiques

Résumé

Abstract Health and resilience of the coral holobiont depend on diverse bacterial communities often dominated by key marine symbionts of the Endozoicomonadaceae family. The factors controlling their distribution and their functional diversity remain, however, poorly known. Here, we study the ecology of Endozoicomonadaceae at an ocean basin-scale by sampling specimens from three coral genera ( Pocillopora , Porites , Millepora ) on 99 reefs from 32 islands across the Pacific Ocean. The analysis of 2447 metabarcoding and 270 metagenomic samples reveals that each coral genus harbored a distinct new species of Endozoicomonadaceae . These species are composed of nine lineages that have distinct biogeographic patterns. The most common one, found in Pocillopora , appears to be a globally distributed symbiont with distinct metabolic capabilities, including the synthesis of amino acids and vitamins not produced by the host. The other lineages are structured partly by the host genetic lineage in Pocillopora and mainly by the geographic location in Porites . Millepora is more rarely associated to Endozoicomonadaceae . Our results show that different coral genera exhibit distinct strategies of host- Endozoicomonadaceae associations that are defined at the bacteria lineage level.

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Sciences de l'environnement
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https://hal.science/hal-04176293

Soumis le : samedi 12 août 2023-07:54:50

Dernière modification le : lundi 18 novembre 2024-13:22:02

Archivage à long terme le : lundi 13 novembre 2023-18:09:06

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Dates et versions

hal-04176293 , version 1 (12-08-2023)

Licence

Paternité

Identifiants

Citer

Corentin Hochart, Lucas Paoli, Hans-Joachim Ruscheweyh, Guillem Salazar, Emilie Boissin, et al.. Ecology of Endozoicomonadaceae in three coral genera across the Pacific Ocean. Nature Communications, 2023, 14 (1), pp.3037. ⟨10.1038/s41467-023-38502-9⟩. ⟨hal-04176293⟩

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