Ecology of Endozoicomonadaceae in three coral genera across the Pacific Ocean
2 Institute of Microbiology and Swiss Institute of Bioinformatics
3 D-BIOL - Department of Biology [ETH Zürich]
4 CRIOBE - Centre de recherches insulaires et observatoire de l'environnement
5 GOSEE - Global Oceans Systems Ecology & Evolution - Tara Oceans
6 SBR - Station biologique de Roscoff = Roscoff Marine Station
7 UMR 8030 - Génomique métabolique
8 University of Maine
9 Fondation Tara Ocean
10 JLU - Justus-Liebig-Universität Gießen = Justus Liebig University
11 IRCAN - Institut de Recherche sur le Cancer et le Vieillissement
12 Universität Konstanz
13 LBGB - Laboratoire de Bioinformatique pour la Génomique et la Biodiversité
14 KAUST - King Abdullah University of Science and Technology [Thuwal, Saudi Arabia]
15 LabEX CORAIL - Laboratoire d'Excellence CORAIL
16 Shimoda Marine Research Center
17 IBENS - Institut de biologie de l'ENS Paris
18 AD2M - Adaptation et diversité en milieu marin
19 LSCE - Laboratoire des Sciences du Climat et de l'Environnement [Gif-sur-Yvette]
20 GEOTRAC - Géochrononologie Traceurs Archéométrie
21 Weizmann Institute of Science [Rehovot, Israël]
22 IFR MARRES - Institut Fédératif de Recherche - Ressources Marines
23 LIA ROPSE - Laboratoire International Associé Réponse des Organismes et Populations face au Stress Environnemental - Université Côte d’Azur - Centre Scientifique de Monaco
24 CHU Nice - Centre Hospitalier Universitaire de Nice
25 OncoAge - FHU OncoAge - Pathologies liées à l’âge [CHU Nice]
26 LOV - Laboratoire d'océanographie de Villefranche
27 EMBL-EBI - European Bioinformatics Institute [Hinxton]
28 Martin Ryan Institute
29 Tara Expéditions
30 Tara Ocean Foundation
31 OSU - Oregon State University
32 LECOB - Laboratoire d'Ecogéochimie des environnements benthiques
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Résumé
Health and resilience of the coral holobiont depend on diverse bacterial communities often dominated by key marine symbionts of the Endozoicomonadaceae family. The factors controlling their distribution and their functional diversity remain, however, poorly known. Here, we study the ecology of Endozoicomonadaceae at an ocean basin-scale by sampling specimens from three coral genera ( Pocillopora , Porites , Millepora ) on 99 reefs from 32 islands across the Pacific Ocean. The analysis of 2447 metabarcoding and 270 metagenomic samples reveals that each coral genus harbored a distinct new species of Endozoicomonadaceae . These species are composed of nine lineages that have distinct biogeographic patterns. The most common one, found in Pocillopora , appears to be a globally distributed symbiont with distinct metabolic capabilities, including the synthesis of amino acids and vitamins not produced by the host. The other lineages are structured partly by the host genetic lineage in Pocillopora and mainly by the geographic location in Porites . Millepora is more rarely associated to Endozoicomonadaceae . Our results show that different coral genera exhibit distinct strategies of host- Endozoicomonadaceae associations that are defined at the bacteria lineage level.
Domaines
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