Curated and harmonized gut microbiome 16S rRNA amplicon data from dietary fiber intervention studies in humans - Archive ouverte HAL Accéder directement au contenu
Article Dans Une Revue (Data Paper) Scientific Data Année : 2023

Curated and harmonized gut microbiome 16S rRNA amplicon data from dietary fiber intervention studies in humans

Bruce Hamaker
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Feitong Liu
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Genelle Lunken
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Heather Rasmussen
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Hongwei Zhou
Kelly Swanson
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Maria Ukhanova
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Marion Leclerc
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Martin Gotteland
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Paola Navarrete
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Petia Kovatcheva-Datchary
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Wendy Dahl
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Jennifer Martiny
  • Fonction : Auteur

Résumé

Next generation amplicon sequencing has created a plethora of data from human microbiomes. The accessibility to this scientific data and its corresponding metadata is important for its reuse, to allow for new discoveries, verification of published results, and serving as path for reproducibility. Dietary fiber consumption has been associated with a variety of health benefits that are thought to be mediated by gut microbiota. To enable direct comparisons of the response of the gut microbiome to fiber, we obtained 16S rRNA sequencing data and its corresponding metadata from 11 fiber intervention studies for a total of 2,368 samples. We provide curated and pre-processed genetic data and common metadata for comparison across the different studies.
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Origine : Fichiers éditeurs autorisés sur une archive ouverte
Licence : CC BY - Paternité

Dates et versions

hal-04159505 , version 1 (12-09-2023)

Identifiants

Citer

Cynthia Rodriguez, Ali Keshavarzian, Bruce Hamaker, Feitong Liu, Genelle Lunken, et al.. Curated and harmonized gut microbiome 16S rRNA amplicon data from dietary fiber intervention studies in humans. Scientific Data , 2023, 10 (1), pp. 346. ⟨10.1038/s41597-023-02254-4⟩. ⟨hal-04159505⟩
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