Régulation des gènes par un moteur moléculaire unique aux bactéries
Résumé
Tous les êtres vivants possèdent des mécanismes spécifiques d’adaptation à leur écosystème et, éventuellement, aux variations environnementales. Ce caractère adaptatif est très marqué chez de nombreuses bactéries, capables de vivre ou survivre dans des conditions variables et difficiles, grâce notamment à des mécanismes de régulation post-transcriptionnelle de l’expression de leurs gènes. Je décrirai l’un de ces mécanismes fondamentaux, la terminaison de la transcription Rho-dépendante, qui est unique aux bactéries, essentiel chez de nombreuses espèces et repose sur l’activité d’un moteur moléculaire à activité ARN hélicase, Rho. Je montrerai notamment comment l’exploitation de cette activité ARN hélicase dans une nouvelle stratégie de criblage combinatoire, Helicase-SELEX, nous a permis de cartographier précisément les nombreux sites d’action de Rho à l’échelle d’un génome entier (Escherichia coli). Je discuterai nos résultats dans un contexte de diversité bactérienne, d’adaptation conditionnelle et d’exploitation de l’activité hélicase à des fins biotechnologiques