L'imagerie médicale permet au biomécanicien d'obtenir des données géométriques in vivo pour la modélisations mécanique patient-spécifique des tissus organiques. Des entreprises comme Sim&Cure s'appuient sur de telles modélisations pour prédire le placement de dispositifs médicaux implantables intracraniens. Cependant, les données géométriques issues de l'imagerie correspondent à une configuration déformée des structures anatomiques dont le comportement non-linéaire prévient de trouver de façon triviale la géométrie libre de contraintes nécessaire à la simulation dans la plupart des codes de calcul. Il existe des méthodes numériques qui associent à une telle géométrie déformée, dont on suppose le chargement connu, une configuration libre de contraintes. Ces méthodes nécessitent d'utiliser un solveur de mécanique des structures et s'appuient généralement sur une modélisation éléments finis volumiques. Nos travaux visent à appliquer de telles méthodes à des simulations s'appuyant sur des éléments coques ou poutres et à en présenter des limitations.