Structural variation analysis of 6,500 whole genome sequences in amyotrophic lateral sclerosis - Archive ouverte HAL Accéder directement au contenu
Article Dans Une Revue npj Genomic Medicine Année : 2022

Structural variation analysis of 6,500 whole genome sequences in amyotrophic lateral sclerosis

Ahmad Al Khleifat
Alfredo Iacoangeli
  • Fonction : Auteur
Harry Bowles
  • Fonction : Auteur
Matthieu Moisse
Johnathan Cooper-Knock
  • Fonction : Auteur
Simon Topp
  • Fonction : Auteur
Ross Byrne
Victoria López
Ashley Jones
Sarah Opie-Martin
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Atay Vural
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Wouter van Rheenen
Kevin Kenna
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Markus Weber
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Bradley Smith
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Isabella Fogh
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Vincenzo Silani
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Karen Morrison
Richard Dobson
Michael van Es
Russell Mclaughlin
Patrick Vourc'H
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  • PersonId : 1215595
Adriano Chio
Philippe Corcia
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Mamede de Carvalho
Marc Gotkine
Monica Panades
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Jesus Mora
Pamela Shaw
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John Landers
Jonathan Glass
Christopher Shaw
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Nazli Basak
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Orla Hardiman
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Wim Robberecht
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Philip van Damme
Leonard van den Berg
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Jan Veldink
Ammar Al-Chalabi
Patrick Vourc’h

Résumé

Abstract There is a strong genetic contribution to Amyotrophic lateral sclerosis (ALS) risk, with heritability estimates of up to 60%. Both Mendelian and small effect variants have been identified, but in common with other conditions, such variants only explain a little of the heritability. Genomic structural variation might account for some of this otherwise unexplained heritability. We therefore investigated association between structural variation in a set of 25 ALS genes, and ALS risk and phenotype. As expected, the repeat expansion in the C9orf72 gene was identified as associated with ALS. Two other ALS-associated structural variants were identified: inversion in the VCP gene and insertion in the ERBB4 gene. All three variants were associated both with increased risk of ALS and specific phenotypic patterns of disease expression. More than 70% of people with respiratory onset ALS harboured ERBB4 insertion compared with 25% of the general population, suggesting respiratory onset ALS may be a distinct genetic subtype.
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Origine : Publication financée par une institution

Dates et versions

hal-03939759 , version 1 (11-04-2024)

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Citer

Ahmad Al Khleifat, Alfredo Iacoangeli, Joke van Vugt, Harry Bowles, Matthieu Moisse, et al.. Structural variation analysis of 6,500 whole genome sequences in amyotrophic lateral sclerosis. npj Genomic Medicine, 2022, 7 (1), pp.8. ⟨10.1038/s41525-021-00267-9⟩. ⟨hal-03939759⟩
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