Cryptic and abundant marine viruses at the evolutionary origins of Earth’s RNA virome - Archive ouverte HAL
Article Dans Une Revue Science Année : 2022

Cryptic and abundant marine viruses at the evolutionary origins of Earth’s RNA virome

Ahmed Zayed
James Wainaina
Guillermo Dominguez-Huerta
Eric Pelletier
  • Fonction : Auteur
Jiarong Guo
Mohamed Mohssen
Funing Tian
Akbar Adjie Pratama
Benjamin Bolduc
Olivier Zablocki
  • Fonction : Auteur
Dylan Cronin
Lindsey Solden
  • Fonction : Auteur
Erwan Delage
Adriana Alberti
Jean-Marc Aury
Quentin Carradec
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Corinne da Silva
Karine Labadie
Julie Poulain
Hans-Joachim Ruscheweyh
Guillem Salazar
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Elan Shatoff
Ralf Bundschuh
Kurt Fredrick
Laura Kubatko
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Samuel Chaffron
Alexander Culley
Shinichi Sunagawa
Jens Kuhn
Patrick Wincker
Matthew Sullivan
Silvia Acinas
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Peer Bork
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Emmanuel Boss
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Chris Bowler
Guy Cochrane
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Colomban de Vargas
Gabriel Gorsky
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Lionel Guidi
Nigel Grimsley
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Pascal Hingamp
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Daniele Iudicone
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Olivier Jaillon
Stefanie Kandels
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Lee Karp-Boss
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Eric Karsenti
  • Fonction : Auteur
Fabrice Not
  • Fonction : Auteur
Hiroyuki Ogata
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Nicole Poulton
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Stéphane Pesant
  • Fonction : Auteur
Christian Sardet
  • Fonction : Auteur
Sabrinia Speich
  • Fonction : Auteur
Lars Stemmann
Matthew Sullivan
  • Fonction : Auteur
Shinichi Sungawa
  • Fonction : Auteur
Patrick Wincker
  • Fonction : Auteur

Résumé

Whereas DNA viruses are known to be abundant, diverse, and commonly key ecosystem players, RNA viruses are insufficiently studied outside disease settings. In this study, we analyzed ≈28 terabases of Global Ocean RNA sequences to expand Earth’s RNA virus catalogs and their taxonomy, investigate their evolutionary origins, and assess their marine biogeography from pole to pole. Using new approaches to optimize discovery and classification, we identified RNA viruses that necessitate substantive revisions of taxonomy (doubling phyla and adding >50% new classes) and evolutionary understanding. “Species”-rank abundance determination revealed that viruses of the new phyla “ Taraviricota ,” a missing link in early RNA virus evolution, and “ Arctiviricota ” are widespread and dominant in the oceans. These efforts provide foundational knowledge critical to integrating RNA viruses into ecological and epidemiological models.

Dates et versions

hal-03872940 , version 1 (26-11-2022)

Identifiants

Citer

Ahmed Zayed, James Wainaina, Guillermo Dominguez-Huerta, Eric Pelletier, Jiarong Guo, et al.. Cryptic and abundant marine viruses at the evolutionary origins of Earth’s RNA virome. Science, 2022, 376 (6589), pp.156-162. ⟨10.1126/science.abm5847⟩. ⟨hal-03872940⟩

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