Les tourbières sont des écosystèmes emblématiques des Pyrénées où se concentre une biodiversité originale et bien souvent menacée du fait de la régression de ces milieux par l’action du changement climatique et de l’utilisation de ces espaces naturels. Bien que l’étude de la diversité des micro-organismes dans les tourbières soit l’objet d’un intérêt croissant, les processus maintenant cette diversité et son rôle dans le fonctionnement et la stabilité des tourbières reste à ce jour très peu explorés. Il apparait donc primordial de mieux connaître ces microorganismes à la fois au niveau taxonomique et fonctionnel, d’identifier les variables environnementales responsables de la variabilité spatio-temporelle de ces communautés pour mieux quantifier leur réponse face aux bouleversements climatiques futurs. Nous avons donc cherché à mieux comprendre l’écologie des communautés microbiennes des tourbières pyrénéennes en étudiant la distribution spatiale et temporelle de ces communautés au sein de la tourbière de Bernadouze (haute vallée du Vicdessos en Ariège). Grâce à un échantillonnage intensif, nous avons pu mettre en évidence que la saison et les microhabitats (e.g. buttes, gouille) avaient peu d’influence sur la structure des communautés. A l’inverse, le pH, la distance à la nappe phréatique et dans une moindre mesure le rapport carbone/azote ont été identifiés comme étant les déterminants majeurs des variations de diversité et composition des communautés microbiennes, traduisant une distribution spatiale non aléatoire des bactéries et des archées. L’importante masse de données acquises dans le cadre de ce projet a également permis d’établir une base solide pour comprendre et suivre le fonctionnement des tourbières pyrénéennes.