A year of genomic surveillance reveals how the SARS-CoV-2 pandemic unfolded in Africa
2 SU - Stellenbosch University
3 Laboratório de Biologia Molecular de Flavivírus [Rio de Janeiro]
4 UFMG - Universidade Federal de Minas Gerais = Federal University of Minas Gerais
5 UC - University of Cincinnati
6 University of Cape Town
7 NC State - North Carolina State University [Raleigh]
8 TransVIHMI - Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses endémiques et émergentes
9 Institut Pasteur de Dakar
10 University of Chicago
11 Institut Pasteur de Madagascar
12 Génomique évolutive des virus à ARN - Evolutionary genomics of RNA viruses
13 CHM / CH Mayotte - Centre hospitalier de Mayotte [Mamoudzou]
14 Centre Pasteur du Cameroun
15 GMV-ARN (UMR_3569 / U-Pasteur_2) - Génétique Moléculaire des Virus à ARN - Molecular Genetics of RNA Viruses
16 CNR - laboratoire coordonnateur - Centre National de Référence des virus des infections respiratoires (dont la grippe) - National Reference Center Virus Influenzae [Paris]
17 جامعة صفاقس - Université de Sfax - University of Sfax
18 NICD - National Institute for Communicable Diseases [Johannesburg]
19 WITS - University of the Witwatersrand [Johannesburg]
20 CHUSS - Centre Hospitalier Universitaire Souro Sanou [Bobo-Dioulasso]
21 CAPRISA - Centre for the AIDS Programme of Research [Durban, South Africa]
22 University of Washington [Seattle]
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Résumé
SARS-CoV-2 across Africa The impact of the severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) pandemic has been hard to track in African countries, largely because of patchy data. Wilkinson et al . curated viral genomes collected in 2021 from several countries across the continent. Outbreaks during 2020 in each African country were initiated by imported cases, mostly from Europe. As the pandemic developed, case numbers in African countries were likely many times higher than reported, and subsequent waves of the pandemic appear to have been more severe. Consequently, high-transmission variants have emerged that have spread within the continent, and African countries must be included in global control efforts. —CA
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