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Poster De Conférence Année : 2011

Développement d’une méthode de caractérisation de peptides plasmatiques

Résumé

Le Plasma et plus particulièrement le Protéome plasmatique, fait l’objet d’une attention particulière, avec d’innombrables projets tendant à le caractériser précisément afin de mettre en évidence des biomolécules d’intérêts. C’est un défi difficile de par la complexité du mélange et de ce fait encore peu de travaux ont véritablement aboutis à la découverte et la validation de biomarqueurs pouvant être exploités à grande échelle. L’étude d’une sous-fraction de ce Protéome plasmatique est une solution pour réduire la complexité, et ainsi pouvoir avoir un champ exploratoire plus accessible en spectrométrie de masse. C’est pourquoi, nous avons choisit d’étudier la fraction protéomique de faible masse moléculaire du plasma, que l’on appellera Peptidome plasmatique. Néanmoins, appréhender cette fraction reste encore un challenge important car la fraction peptidique est en mélange avec une quantité importante d’autres molécules et en premier lieu, les protéines qui sont très majoritaires. Pour pouvoir éliminer les protéines, la précipitation par des solvants est une des méthodes de référence employée dans les problématiques de dosages des petites molécules dans le plasma. Dans cette étude nous allons évaluer si elle peut être aussi la méthode de référence pour l’étude du Peptidome, en la comparant aussi avec des méthodes simples de préparation comme ultrafiltration ou la chromatographie SPE. Les différentes fractions peptidomiques obtenues seront analysés par spectrométrie MALDI-TOF (DE-PRO, ABSciex) et ESIIT (LTQ Velos,ThermoFisher). Les résultats obtenus seront analysés à la fois sur l’exhaustivité de l’empreinte peptidiques obtenue mais aussi dans le cadre de la mise au point d’une étude encore plus spécifique sur les peptides phosphorylés du peptidome. Nous présenterons, un workflow le plus efficace possible permettant à la fois d’obtenir efficacement un sous-protéome peptidique mais aussi un sous peptidome phosphorylée avec l’utilisation de micro-colonne contenant une résine de dioxyde de titane. Ce PhosphoPeptidome est très intéressant, car le rôle des peptides phosphorylés libérée dans la circulation sanguine est encore peu exploré du fait de la difficulté de mettre au point une méthode de purification efficace dans ce milieu complexe.
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Origine : Fichiers produits par l'(les) auteur(s)

Dates et versions

hal-03665703 , version 1 (12-05-2022)

Identifiants

  • HAL Id : hal-03665703 , version 1

Citer

Delphine Centeno, Viala Didier, Hafnaoui Nordine, Sayd Thierry, Pinguet Jérémy, et al.. Développement d’une méthode de caractérisation de peptides plasmatiques. SFSM 2011, Sep 2011, Avignon, France. ⟨hal-03665703⟩

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