A travers la France, une cinquantaine de stations de comptage des migrateurs (STACOMI) a été mise en place pour obtenir des informations sur l’état qualitatif et quantitatif des populations de poissons migrateurs et leurs flux migratoires. Ces stations, bien que très informatives, ne permettent souvent d’obtenir qu’une observation partielle des flux de poissons (couverture du dispositif d’observation inférieure à la largeur/hauteur du cours d’eau, présence d’un bras de contournement ou d’un bief, efficacité du dispositif dépendante du débit ou de la turbidité). Les effectifs dénombrés sont donc plus ou moins différents des flux réels de poissons, et en l’absence d’une estimation des abondances, l’interprétation et la comparaison spatio-temporelle des données issues de ces stations de comptage est délicate. C’est dans ce contexte que notre travail s’inscrit. L’objectif de l’action AFB-INRA (projet Toolbox) est de proposer des outils pour estimer l’efficacité de détection des systèmes d’observation en place et l’abondance des poissons (stock en place ou de flux migrants). Pour cela, une approche combinant observations et modélisation a été développée. Dans un premier temps, une caméra acoustique ARIS est installée temporairement en complément de la station de comptage (à proximité immédiate). Après la période d’observation, les données issues des deux dispositifs de comptage (dispositif existant à la station de comptage et ARIS) seront couplées et utilisées dans un modèle hiérarchique bayésien pour estimer le flux de migration et la probabilité de détection du dispositif existant et de la caméra acoustique. Pour une utilisation optimale de la boite à outils, des recommandations sur la mise en oeuvre de l’approche sont décrites.