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Article Dans Une Revue PeerJ Année : 2020

The land flatworm Amaga expatria (Geoplanidae) in Guadeloupe and Martinique: new reports and molecular characterization including complete mitogenome

Le Plathelminthe terrestre Amaga expatria (Geoplanidae) en Guadeloupe et Martinique: nouveaux signalements et caractérisation moléculaire, dont le mitogénome complet

Résumé

Background: The land flatworm Amaga expatria Jones & Sterrer, 2005 (Geoplanidae) was described from two specimens collected in Bermuda in 1963 and 1988 and not recorded since. Methods: On the basis of a citizen science project, we received observations in the field, photographs and specimens from non-professionals and local scientists in Martinique and Guadeloupe. We barcoded (COI) specimens from both islands and studied the histology of the reproductive organs of one specimen. Based on Next Generation Sequencing, we obtained the complete mitogenome of A. expatria and some information on its prey from contaminating DNA. Results: We add records from 2006 to 2019 in two French islands of the Caribbean arc, Guadeloupe (six records) and Martinique (14 records), based on photographs obtained from citizen science and specimens examined. A specimen from Martinique was studied for histology of the copulatory organs and barcoded for the COI gene; its anatomy was similar to the holotype, therefore confirming species identification. The COI gene was identical for several specimens from Martinique and Guadeloupe and differed from the closest species by more than 10%; molecular characterisation of the species is thus possible by standard molecular barcoding techniques. The mitogenome is 14,962 bp in length and contains 12 protein coding genes, two rRNA genes and 22 tRNA genes; for two protein genes it was not possible to determine the start codon. The mitogenome was compared with the few available mitogenomes from geoplanids and the most similar was Obama nungara, a species from South America. An analysis of contaminating DNA in the digestive system suggests that A. expatria preys on terrestrial molluscs, and citizen science observations in the field suggest that prey include molluscs and earthworms; the species thus could be a threat to biodiversity of soil animals in the Caribbean.
Contexte : Le Plathelminthe terrestre Amaga expatria Jones & Sterrer, 2005 (Geoplanidae) a été décrit à partir de deux spécimens collectés aux Bermudes en 1963 et 1988 et n'a pas été signalé depuis 2005. Méthodes : Grâce à un projet de science participative, nous avons reçu des observations sur le terrain, des photographies et des spécimens de la part de non-professionnels et de scientifiques locaux, en Martinique et en Guadeloupe. Nous avons barcodé des spécimens (COI) des deux îles et étudié l'histologie des organes reproducteurs d'un spécimen. Par séquençage de nouvelle génération, nous avons obtenu le mitogénome complet d'A. expatria et des informations sur ses proies à partir de l'ADN contaminant. Résultats : Nous rapportons des signalements de 2006 à 2019 dans deux îles françaises de l'arc caribéen, la Guadeloupe (six signalements) et la Martinique (14 signalements), à partir de photographies issues de la science participative et de spécimens examinés. Un spécimen de Martinique a été étudié pour l'histologie des organes copulateurs et a été barcodé pour le gène COI ; son anatomie était similaire à l'holotype, confirmant ainsi l'identification de l’espèce. Le gène COI était identique pour plusieurs spécimens de Martinique et de Guadeloupe et différait de plus de 10% des espèces les plus proches ; la caractérisation moléculaire de l'espèce est ainsi possible par des techniques classiques de codes-barres moléculaires. Le mitogénome a une longueur de 14962 pb et contient 12 gènes codant pour les protéines, deux gènes d'ARNr et 22 gènes d'ARNt ; pour deux gènes codants, il n'a pas été possible de déterminer le codon de départ. Le mitogénome a été comparé aux quelques mitogénomes disponibles des Geoplanidae et le plus similaire était Obama nungara, une espèce d'Amérique du Sud. Une analyse de l'ADN contaminant dans le système digestif suggère qu’A. expatria se nourrit de mollusques terrestres, et les observations de la science citoyenne sur le terrain suggèrent que ses proies comprennent des mollusques et des vers de terre ; l'espèce pourrait donc constituer une menace pour la biodiversité des animaux du sol dans les Caraïbes.
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Citer

Jean-Lou Justine, Delphine Gey, Jessica Thévenot, Romain Gastineau, Hugh D Jones. The land flatworm Amaga expatria (Geoplanidae) in Guadeloupe and Martinique: new reports and molecular characterization including complete mitogenome. PeerJ, 2020, 8, pp.e10098. ⟨10.7717/peerj.10098⟩. ⟨hal-03009270⟩
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