Bisimilar Conversion of Multi-valued Networks to Boolean Networks
Conversion Bisimilaire des réseaux multi-valués en réseaux booléens
Résumé
Discrete modelling frameworks of Biological networks can be divided in two distinct categories: Boolean and Multi-valued. Although Multi-valued networks are more expressive for qualifying the regulatory behaviours modelled by more than two values, the ability to automatically convert them to Boolean network with an equivalent behaviour breaks down the fundamental borders between the two approaches. Theoretically investigating the conversion process provides relevant insights into bridging the gap between them. Basically, the conversion aims at finding a Boolean network bisimulating a Multi-valued one. In this article, we investigate the bisimilar conversion where the Boolean integer coding is a parameter that can be freely modified. Based on this analysis, we define a computational method automatically inferring a bisimilar Boolean network from a given Multi-valued one.
Les cadres de modélisation discrets des réseaux biologiques se distinguent en deux catégories: booléennes et à valeurs multiples. Bien que les réseaux à valeurs multiples soient plus expressifs pour qualifier le comportement des réseaux moléculaires, modélisés par plus de deux valeurs, la possibilité de les convertir automatiquement en réseau booléen avec un comportement équivalent amenuise les frontières fondamentales entre ces deux approches. Une étude théorique du processus de conversion permet de combler l'écart entre eux. Fondamentalement, la conversion a pour enjeu de trouver un réseau booléen bisimulant un réseau à valeurs multiples. Dans cet article, nous étudions la conversion bisimilaire où le codage entier booléen en est un paramètre qui peut être librement modifié.De cette analyse, nous définirons une méthode de calcul inférant automatiquement un réseau booléen bisimilaire à partir d'un réseau à valeurs multiples donné.
| Origine | Fichiers produits par l'(les) auteur(s) |
|---|
Loading...