Population structure of modern-day Italians reveals patterns of ancient and archaic ancestries in Southern Europe
A. Raveane
(1, 2)
,
S. Aneli
(2)
,
F. Montinaro
(2)
,
G. Athanasiadis
(3)
,
S. Barlera
(4)
,
G. Birolo
(5)
,
G. Boncoraglio
(6)
,
A. Di Blasio
,
C. Di Gaetano
(7)
,
L. Pagani
(8)
,
S. Parolo
,
P. Paschou
,
A. Piazza
(7)
,
G. Stamatoyannopoulos
,
A. Angius
,
N. Brucato
,
F. Cucca
,
G. Hellenthal
,
A. Mulas
,
M. Peyret-Guzzon
,
M. Zoledziewska
,
A. Baali
,
C. Bycroft
,
M. Cherkaoui
(9)
,
J. Chiaroni
(10)
,
J. Di Cristofaro
(11)
,
C. Dina
(12)
,
J. Dugoujon
,
Pilar Galan
(13, 14)
,
J. Giemza
,
T. Kivisild
,
M. Melhaoui
,
M. Metspalu
,
S. Myers
,
L. Pereira
,
F. Ricaut
(15)
,
F. Brisighelli
,
I. Cardinali
,
V. Grugni
,
H. Lancioni
,
V. Pascali
,
A. Torroni
(16)
,
O. Semino
,
G. Matullo
,
A. Achilli
(17)
,
A. Olivieri
,
C. Capelli
,
Stéphane Mazieres
(11)
1
DBB UNIPV -
Dipartimento di Biologia e Biotecnologie "Lazzaro Spallanzani" = Department of Biology and Biotechnology [Univ di Pavia]
2 University of Oxford
3 Aarhus University [Aarhus]
4 Istituto di Ricerche Farmacologiche Mario Negri
5 UNITO - Università degli studi di Torino = University of Turin
6 Fondazione IRCCS Istituto Neurologico "Carlo Besta"
7 Dipartimento di Genetica, Biologica e Biochimica
8 LERMA - Laboratoire d'Etude du Rayonnement et de la Matière en Astrophysique
9 Georgia Tech Lorraine [Metz]
10 EFS - Alpes-Méditerranée - Etablissement Français du Sang - Alpes-Méditerranée
11 ADES - Anthropologie bio-culturelle, Droit, Ethique et Santé
12 GMM - Génétique des maladies multifactorielles
13 UREN - Unité de Recherche en Epidémiologie Nutritionnelle
14 CRESS - U1153 - Equipe 3: EREN- Equipe de Recherche en Epidémiologie Nutritionnelle
15 CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique
16 Dipartimento di Genetica e Microbiologica
17 Dipartimento di Genetica e Microbiologia
2 University of Oxford
3 Aarhus University [Aarhus]
4 Istituto di Ricerche Farmacologiche Mario Negri
5 UNITO - Università degli studi di Torino = University of Turin
6 Fondazione IRCCS Istituto Neurologico "Carlo Besta"
7 Dipartimento di Genetica, Biologica e Biochimica
8 LERMA - Laboratoire d'Etude du Rayonnement et de la Matière en Astrophysique
9 Georgia Tech Lorraine [Metz]
10 EFS - Alpes-Méditerranée - Etablissement Français du Sang - Alpes-Méditerranée
11 ADES - Anthropologie bio-culturelle, Droit, Ethique et Santé
12 GMM - Génétique des maladies multifactorielles
13 UREN - Unité de Recherche en Epidémiologie Nutritionnelle
14 CRESS - U1153 - Equipe 3: EREN- Equipe de Recherche en Epidémiologie Nutritionnelle
15 CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique
16 Dipartimento di Genetica e Microbiologica
17 Dipartimento di Genetica e Microbiologia
A. Di Blasio
- Fonction : Auteur
L. Pagani
- Fonction : Auteur
- PersonId : 173664
- IdHAL : laurent-pagani
- ORCID : 0000-0002-3319-1021
- IdRef : 031462812
S. Parolo
- Fonction : Auteur
P. Paschou
- Fonction : Auteur
G. Stamatoyannopoulos
- Fonction : Auteur
A. Angius
- Fonction : Auteur
N. Brucato
- Fonction : Auteur
F. Cucca
- Fonction : Auteur
G. Hellenthal
- Fonction : Auteur
A. Mulas
- Fonction : Auteur
M. Peyret-Guzzon
- Fonction : Auteur
M. Zoledziewska
- Fonction : Auteur
A. Baali
- Fonction : Auteur
C. Bycroft
- Fonction : Auteur
J. Chiaroni
- Fonction : Auteur
- PersonId : 748906
- IdHAL : jacques-chiaroni
- ORCID : 0000-0002-3133-8990
J. Dugoujon
- Fonction : Auteur
Pilar Galan
- Fonction : Auteur
- PersonId : 756893
- ORCID : 0000-0003-1706-3107
J. Giemza
- Fonction : Auteur
T. Kivisild
- Fonction : Auteur
M. Melhaoui
- Fonction : Auteur
M. Metspalu
- Fonction : Auteur
S. Myers
- Fonction : Auteur
L. Pereira
- Fonction : Auteur
F. Brisighelli
- Fonction : Auteur
I. Cardinali
- Fonction : Auteur
V. Grugni
- Fonction : Auteur
H. Lancioni
- Fonction : Auteur
V. Pascali
- Fonction : Auteur
O. Semino
- Fonction : Auteur
G. Matullo
- Fonction : Auteur
A. Olivieri
- Fonction : Auteur
C. Capelli
- Fonction : Auteur
- PersonId : 785438
- ORCID : 0000-0003-3330-621X
Stéphane Mazieres
- Fonction : Auteur
- PersonId : 5571
- IdHAL : stephane-mazieres
- ORCID : 0000-0003-1266-4659
- IdRef : 112488900
Résumé
European populations display low genetic differentiation as the result of long-term blending of their ancient founding ancestries. However, it is unclear how the combination of ancient ancestries related to early foragers, Neolithic farmers, and Bronze Age nomadic pastoralists can explain the distribution of genetic variation across Europe. Populations in natural crossroads like the Italian peninsula are expected to recapitulate the continental diversity, but have been systematically understudied. Here, we characterize the ancestry profiles of Italian populations using a genome-wide dataset representative of modern and ancient samples from across Italy, Europe, and the rest of the world. Italian genomes capture several ancient signatures, including a non-steppe contribution derived ultimately from the Caucasus. Differences in ancestry composition, as the result of migration and admixture, have generated in Italy the largest degree of population structure detected so far in the continent, as well as shaping the amount of Neanderthal DNA in modern-day populations.
Domaines
Anthropologie biologique
Origine : Fichiers éditeurs autorisés sur une archive ouverte
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