A recent bottleneck of Y chromosome diversity coincides with a global change in culture
Monika Karmin
,
Lauri Saag
,
Mário Vicente
,
Melissa Wilson Sayres
,
Mari Järve
,
Ulvi Gerst Talas
,
Siiri Rootsi
(1)
,
Anne-Mai Ilumäe
,
Reedik Mägi
,
Mario Mitt
,
Luca Pagani
,
Tarmo Puurand
,
Zuzana Faltyskova
,
Florian Clemente
,
Alexia Cardona
,
Ene Metspalu
(2)
,
Hovhannes Sahakyan
,
Bayazit Yunusbayev
,
Georgi Hudjashov
,
Michael Degiorgio
,
Eva-Liis Loogväli
,
Chris Eichstaedt
,
Mikk Eelmets
,
Gyaneshwer Chaubey
,
Kristiina Tambets
,
Sergei Litvinov
,
Maru Mormina
(3)
,
Yali Xue
(4)
,
Qasim Ayub
,
Grigor Zoraqi
,
Thorfinn Sand Korneliussen
,
Farida Akhatova
,
Joseph Lachance
,
Sarah Tishkoff
(5)
,
Kuvat Momynaliev
,
François-Xavier Ricaut
(6, 7)
,
Pradiptajati Kusuma
(8)
,
Harilanto Razafindrazaka
(9)
,
Denis Pierron
(8)
,
Murray Cox
,
Gazi Nurun Nahar Sultana
,
Rane Willerslev
,
Craig Muller
,
Michael Westaway
,
David Lambert
(10)
,
Vedrana Skaro
,
Lejla Kovačevic
,
Shahlo Turdikulova
,
Dilbar Dalimova
,
Rita Khusainova
,
Natalya Trofimova
,
Vita Akhmetova
,
Irina Khidiyatova
,
Daria Lichman
,
Jainagul Isakova
(11)
,
Elvira Pocheshkhova
,
Zhaxylyk Sabitov
,
Nikolay Barashkov
,
Pagbajabyn Nymadawa
(12)
,
Evelin Mihailov
,
Joseph Wee Tien Seng
,
Irina Evseeva
(13)
,
Andrea Migliano
,
Syafiq Abdullah
,
George Andriadze
,
Dragan Primorac
,
Lubov Atramentova
,
Olga Utevska
,
Levon Yepiskoposyan
,
Damir Marjanovic
,
Alena Kushniarevich
,
Doron Behar
,
Chris Gilissen
,
Lisenka Vissers
(14)
,
Joris A Veltman
(15)
,
Elena Balanovska
,
Miroslava Derenko
,
Boris Malyarchuk
,
Andres Metspalu
(16)
,
Sardana Fedorova
,
Anders Eriksson
(17)
,
Andrea Manica
,
Fernando Méndez
(18)
,
Tatiana Karafet
,
Krishna Veeramah
,
Neil Bradman
,
Michael Hammer
,
Ludmila Osipova
(19)
,
Oleg Balanovsky
(20)
,
Elza K. Khusnutdinova
(21)
,
Knut Johnsen
,
Maido Remm
,
Mark Thomas
,
Chris Tyler-Smith
(22)
,
Peter Underhill
(23)
,
Eske Willerslev
(24)
,
Rasmus Nielsen
(25)
,
Mait Metspalu
(2)
,
Richard Villems
(26)
,
Toomas Kivisild
(3)
,
Melissa Sayres
,
Mari Mitt
,
Christina Eichstaedt
,
Lejla Kovačevic´
,
Joseph Seng
,
Andrea Bamberg Migliano
,
Damir Marjanovic´
,
Christian Gilissen
(15)
1
Dept Evolutionary Biol,
2 University of Tartu
3 Leverhulme Centre for Human Evolutionary Studies University of Cambridge
4 Human Evolution
5 University of Pennsylvania
6 Human Genetics
7 CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique
8 AMIS - Anthropologie Moléculaire et Imagerie de Synthèse
9 AMU - Aix Marseille Université
10 Environmental Futures Research Institute
11 Institute of Molecular Biology and Medicine
12 INSPIRE - International Network for the Sequencing of resPIRratory vIrusEs
13 Department of Oncology
14 Human Genetics
15 Radboud University Medical Center [Nijmegen]
16 The Estonian Genome Center
17 IRF - Swedish Institute of Space Physics [Uppsala / Kiruna]
18 Marketing Department
19 Institute of Cytology and Genetics
20 Russian Academy of Medical Sciences
21 Institute of Biochemistry and Genetics [Bashkortostan Republic, Russia]
22 Wellcome Trust Genome Campus
23 Department of Psychiatry and Behavioral Sciences [Stanford]
24 Section for GeoGenetics
25 Dept Integrat Biol
26 UAABC - Anthropologie Bio-Culturelle
2 University of Tartu
3 Leverhulme Centre for Human Evolutionary Studies University of Cambridge
4 Human Evolution
5 University of Pennsylvania
6 Human Genetics
7 CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique
8 AMIS - Anthropologie Moléculaire et Imagerie de Synthèse
9 AMU - Aix Marseille Université
10 Environmental Futures Research Institute
11 Institute of Molecular Biology and Medicine
12 INSPIRE - International Network for the Sequencing of resPIRratory vIrusEs
13 Department of Oncology
14 Human Genetics
15 Radboud University Medical Center [Nijmegen]
16 The Estonian Genome Center
17 IRF - Swedish Institute of Space Physics [Uppsala / Kiruna]
18 Marketing Department
19 Institute of Cytology and Genetics
20 Russian Academy of Medical Sciences
21 Institute of Biochemistry and Genetics [Bashkortostan Republic, Russia]
22 Wellcome Trust Genome Campus
23 Department of Psychiatry and Behavioral Sciences [Stanford]
24 Section for GeoGenetics
25 Dept Integrat Biol
26 UAABC - Anthropologie Bio-Culturelle
Monika Karmin
- Fonction : Auteur
Lauri Saag
- Fonction : Auteur
Mário Vicente
- Fonction : Auteur
Melissa Wilson Sayres
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Ulvi Gerst Talas
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Anne-Mai Ilumäe
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Joseph Lachance
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Kuvat Momynaliev
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François-Xavier Ricaut
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- PersonId : 181458
- IdHAL : francois-xavier-ricaut
- ORCID : 0000-0001-7609-7898
- IdRef : 139293590
Harilanto Razafindrazaka
- Fonction : Auteur
- PersonId : 750256
- IdHAL : harilanto-razafindrazaka
- ORCID : 0000-0001-5209-4780
- IdRef : 161284108
Denis Pierron
- Fonction : Auteur
- PersonId : 954495
- IdHAL : denis-pierron
- ORCID : 0000-0003-1383-6774
Murray Cox
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Gazi Nurun Nahar Sultana
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Rane Willerslev
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Craig Muller
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Michael Westaway
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Vedrana Skaro
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Lejla Kovačevic
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Shahlo Turdikulova
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Dilbar Dalimova
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Natalya Trofimova
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Daria Lichman
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Elvira Pocheshkhova
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Evelin Mihailov
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Joseph Wee Tien Seng
- Fonction : Auteur
Andrea Migliano
- Fonction : Auteur
Syafiq Abdullah
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George Andriadze
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Dragan Primorac
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Lubov Atramentova
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Olga Utevska
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Levon Yepiskoposyan
- Fonction : Auteur
Damir Marjanovic
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Alena Kushniarevich
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Doron Behar
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Chris Gilissen
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Elena Balanovska
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Miroslava Derenko
- Fonction : Auteur
Boris Malyarchuk
- Fonction : Auteur
Sardana Fedorova
- Fonction : Auteur
Anders Eriksson
- Fonction : Auteur
- PersonId : 771171
- ORCID : 0000-0003-3436-3726
Andrea Manica
- Fonction : Auteur
- PersonId : 771172
- ORCID : 0000-0003-1895-450X
Tatiana Karafet
- Fonction : Auteur
Krishna Veeramah
- Fonction : Auteur
Neil Bradman
- Fonction : Auteur
Michael Hammer
- Fonction : Auteur
Knut Johnsen
- Fonction : Auteur
Maido Remm
- Fonction : Auteur
Mark Thomas
- Fonction : Auteur
- PersonId : 758180
- ORCID : 0000-0002-2452-981X
Melissa Sayres
- Fonction : Auteur
Mari Mitt
- Fonction : Auteur
Christina Eichstaedt
- Fonction : Auteur
Lejla Kovačevic´
- Fonction : Auteur
Joseph Seng
- Fonction : Auteur
Andrea Bamberg Migliano
- Fonction : Auteur
Damir Marjanovic´
- Fonction : Auteur
Résumé
It is commonly thought that human genetic diversity in non-African populations was shaped primarily by an out-of-Africa dispersal 50-100 thousand yr ago (kya). Here, we present a study of 456 geographically diverse high-coverage Y chromosome sequences, including 299 newly reported samples. Applying ancient DNA calibration, we date the Y-chromosomal most recent common ancestor (MRCA) in Africa at 254 (95% CI 192-307) kya and detect a cluster of major non-African founder haplogroups in a narrow time interval at 47-52 kya, consistent with a rapid initial colonization model of Eurasia and Oceania after the out-of-Africa bottleneck. In contrast to demographic reconstructions based on mtDNA, we infer a second strong bottleneck in Y-chromosome lineages dating to the last 10 ky. We hypothesize that this bottleneck is caused by cultural changes affecting variance of reproductive success among males.
Domaines
Anthropologie biologiqueOrigine | Fichiers éditeurs autorisés sur une archive ouverte |
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