Séparation d'haplotypes à partir de données de séquençage de troisième génération - Archive ouverte HAL Access content directly
Reports Year : 2018

Séparation d'haplotypes à partir de données de séquençage de troisième génération

Abstract

Les algorithmes d'assemblage actuels n'ont pas de performances satisfaisantes lorsque confrontés à des reads obtenus par des technologies de troisième génération issus de génomes diploïdes très hétérozygotes. On propose alors une méthode pour classer ces reads selon leur haplotype d'origine avant l'étape d'assemblage à partir d'un partitionnement sur les k-mers de ces reads.
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ENS_Rennes_DIT_L3_2018_paper_32.pdf (370.41 Ko) Télécharger le fichier
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Dates and versions

hal-01933561 , version 1 (23-11-2018)

Identifiers

  • HAL Id : hal-01933561 , version 1

Cite

Maxime Bridoux. Séparation d'haplotypes à partir de données de séquençage de troisième génération. [Stage] Inria Rennes - Bretagne Atlantique. 2018. ⟨hal-01933561⟩
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