Le développement du système racinaire résulte de l’équilibre entre les interactions physiques et chimiques avec le sol et la perception de conditions environnementales plus globales comme, par exemple, la gravité terrestre qui permet à la racine de percevoir la verticale. La morphogenèse du système racinaire est en particulier conditionnée par l’apex racinaire qui oriente la croissance longitudinale des racines. L’apex racinaire est connu pour être une zone influencée par les propriétés chimiques et mécaniques de son environnement. Cependant, la rhéologie de l’apex racinaire (lien entre ses déformations et les contraintes auxquelles il est soumis) lors de la progression des racines demeure mal connue. Étudier cette rhéologie nécessite l’observation de la déformation à l’échelle cellulaire de l’apex racinaire dans des conditions in-vivo au sein de milieux aux propriétés mécaniques mesurables et contrôlables. Pour ce faire nous avons développé un microscope à feuillet de lumière (SPIM : Selective Plane Illumination Microscopy) en nous appuyant sur le projet OpenSPIM qui propose des plans sous licence libre pour sa construction. Cette technique d’imagerie par fluorescence connait un gain d’intérêt depuis une dizaine d’années du fait de ses capacités d’imagerie 3D in-vivo permises par une vitesse d’acquisition rapide accompagnée d’une faible phototoxicité. Nous présenterons ici cette technique de microscopie, la construction de cet instrument et ce qu’il apporte pour l’étude de la croissance des racines in-vivo.